More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  100 
 
 		 426 aa  861    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0508  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0567  Resolvase domain protein  30.97 
 
 		 577 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.56 
 
 		 482 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  33.94 
 
 		 502 aa  96.3  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  27.73 
 
 		 500 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  31.23 
 
 		 537 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.37 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  31.23 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  31.62 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.05 
 
 		 534 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  31.23 
 
 		 534 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.39 
 
 		 465 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  31.89 
 
 		 534 aa  93.2  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  30.74 
 
 		 534 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  31.89 
 
 		 534 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.9 
 
 		 272 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  24.59 
 
 		 552 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  29.08 
 
 		 528 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.7 
 
 		 558 aa  90.1  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.52 
 
 		 546 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  28.69 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 485 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.39 
 
 		 522 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  30.23 
 
 		 603 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  22.77 
 
 		 542 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.02 
 
 		 517 aa  87  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.64 
 
 		 548 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.98 
 
 		 475 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  29.15 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  35.68 
 
 		 525 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  30.08 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.39 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  30.49 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  23.23 
 
 		 544 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  34.78 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.79 
 
 		 534 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.49 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  26.54 
 
 		 525 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.97 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  31.36 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  34.13 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  36.25 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.31 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  24.02 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  26.21 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.01 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.84 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  29.89 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  30.72 
 
 		 550 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  29.27 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.02 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  29.89 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  32.39 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  29.27 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2603  putative resolvase  27.08 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00221459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  30.15 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  31.52 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.25 
 
 		 515 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  31.87 
 
 		 665 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  33.55 
 
 		 205 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  29.9 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  24.23 
 
 		 511 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.73 
 
 		 535 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  33.53 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  24.64 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  31.14 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  24.64 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  29.52 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  27.63 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  31.76 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30.38 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  34.52 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  21.08 
 
 		 511 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  31.55 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.76 
 
 		 547 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  23.45 
 
 		 551 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.1 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  35.62 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  31.33 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  27.91 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  27.91 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  27.91 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  22.68 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  28.35 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  30.3 
 
 		 549 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  28.57 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  21.57 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  30.72 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.91 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.88 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  30.99 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  29.41 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>