130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1913 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  100 
 
 
208 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  98.08 
 
 
208 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  46.11 
 
 
219 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  47.12 
 
 
216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  46.35 
 
 
219 aa  161  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  48.21 
 
 
216 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  48.21 
 
 
216 aa  158  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  48.21 
 
 
216 aa  158  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  46.12 
 
 
216 aa  157  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  47.94 
 
 
244 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  47.94 
 
 
216 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  38.39 
 
 
222 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  38.39 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  37.91 
 
 
222 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  43.78 
 
 
215 aa  154  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  38.65 
 
 
209 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  47.42 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  40.84 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  40.84 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  39.06 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  39.06 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  37.32 
 
 
215 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  37.32 
 
 
215 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  36.6 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  36.68 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  35.86 
 
 
222 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  36.68 
 
 
229 aa  131  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  39.63 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  39.39 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  35.68 
 
 
229 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  33.17 
 
 
212 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  34.03 
 
 
202 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 
208 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  37.8 
 
 
207 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  36.7 
 
 
209 aa  121  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  33.88 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  38.34 
 
 
192 aa  118  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  37.82 
 
 
192 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  36.79 
 
 
193 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  35.75 
 
 
194 aa  115  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  34.54 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  35.75 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  35.23 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  35.75 
 
 
192 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  31.53 
 
 
207 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  31.71 
 
 
201 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  34.52 
 
 
201 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  32.68 
 
 
219 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  33.33 
 
 
201 aa  99.4  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  29.69 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  29.69 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  32.45 
 
 
195 aa  94.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  38.3 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  35.26 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  31.61 
 
 
191 aa  89.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  32.65 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  32.8 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  30.92 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  27.04 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  32.14 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  30.96 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  32.8 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  32.98 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  31.91 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  31.91 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  35.21 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  28.43 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  32.31 
 
 
162 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  29.89 
 
 
182 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  46.88 
 
 
94 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  38.1 
 
 
515 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  35.77 
 
 
126 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  38.27 
 
 
336 aa  52  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  38.27 
 
 
128 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  28.26 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  37.04 
 
 
475 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
549 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  37.04 
 
 
569 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  26 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0464  regulatory protein MerR  34.55 
 
 
100 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.169334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  34.57 
 
 
578 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  29.63 
 
 
485 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  32.87 
 
 
532 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  29.25 
 
 
563 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  36.54 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  30.56 
 
 
74 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  32 
 
 
462 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  25.81 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  34.88 
 
 
484 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
521 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  36.36 
 
 
539 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  34.88 
 
 
484 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.31 
 
 
579 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  32.53 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  35.44 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  37.5 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  34.12 
 
 
546 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>