85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0522 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  92.59 
 
 
216 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  93.52 
 
 
216 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  91.2 
 
 
216 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  90.28 
 
 
216 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  90.28 
 
 
216 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  89.81 
 
 
216 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  50.96 
 
 
219 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  49.28 
 
 
216 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  49.04 
 
 
219 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  45.89 
 
 
213 aa  169  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  45.89 
 
 
213 aa  169  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  43.48 
 
 
215 aa  167  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  45.59 
 
 
229 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  45.1 
 
 
229 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  42.36 
 
 
222 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  47.94 
 
 
208 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  45.1 
 
 
229 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  46.23 
 
 
208 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  42.56 
 
 
194 aa  148  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  44.1 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  42.56 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  43.59 
 
 
192 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  42.11 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  42.13 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  42.13 
 
 
195 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  40.21 
 
 
195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  40.21 
 
 
195 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 
197 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  39.68 
 
 
207 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  34.47 
 
 
208 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  34.87 
 
 
206 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  34.87 
 
 
206 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  37.38 
 
 
215 aa  121  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  37.38 
 
 
215 aa  121  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  32.81 
 
 
201 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  40.1 
 
 
191 aa  119  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  39.78 
 
 
202 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  35.64 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  34.15 
 
 
203 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  34.18 
 
 
201 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  34.15 
 
 
203 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  36.92 
 
 
197 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  37.16 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  35.5 
 
 
209 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  34.65 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  34.65 
 
 
222 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  34.16 
 
 
222 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  34.95 
 
 
209 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  34.21 
 
 
207 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  32.87 
 
 
219 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  34.58 
 
 
196 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  33.15 
 
 
195 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  31.73 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  28.22 
 
 
201 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  34.69 
 
 
195 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  35.23 
 
 
193 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  35.39 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  36.15 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  35.38 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  34.62 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  30.56 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  33.14 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  33.14 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  32.09 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  35.66 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  31.11 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  22.75 
 
 
205 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  35.77 
 
 
162 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  29.71 
 
 
182 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  22.75 
 
 
205 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  30.05 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  29.77 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  50.77 
 
 
94 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  42.03 
 
 
74 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  40.58 
 
 
74 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  36.67 
 
 
116 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  33.91 
 
 
128 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  28.97 
 
 
641 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  32.56 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  34.25 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0464  regulatory protein MerR  30.99 
 
 
100 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.169334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  30.4 
 
 
295 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  36.62 
 
 
279 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 
151 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>