77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12900 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  100 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  69.19 
 
 		 202 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  68.56 
 
 		 194 aa  246  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  71.35 
 
 		 193 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  66.32 
 
 		 203 aa  241  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  65.54 
 
 		 190 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  64.33 
 
 		 190 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  64.33 
 
 		 190 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  60.34 
 
 		 197 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  53.4 
 
 		 193 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  61.96 
 
 		 182 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  47.62 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  65.03 
 
 		 162 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  47.64 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  41.88 
 
 		 197 aa  142  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  62.11 
 
 		 116 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 215 aa  85.9  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  32.26 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  30.11 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  30.11 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  37.69 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  34.03 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  36.73 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  37.31 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  36.05 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  36.05 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  42.02 
 
 		 126 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  31.25 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  35.66 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  58.9 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  36.64 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  31.94 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  30.71 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  30.71 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  31.72 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  27.12 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  28.98 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  29.59 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  50 
 
 		 81 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  32.31 
 
 		 202 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  32.17 
 
 		 193 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  32.96 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  32.4 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  27.82 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  27.98 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  35.94 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  27.38 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  27.53 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  30.3 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  28.15 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  31.54 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  24.65 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  31.85 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  32.09 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  33.59 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  34.38 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  30.32 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  29.61 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  29.61 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  31.21 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  31.34 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  56.67 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  32.81 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  27.07 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  28.87 
 
 		 208 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  26.72 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  32.03 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  65 
 
 		 132 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  25.75 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  25.75 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  26.32 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 		 196 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  34.52 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>