82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4506 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  83.53 
 
 		 356 aa  137  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  82.35 
 
 		 356 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  77.01 
 
 		 249 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  76.47 
 
 		 442 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  74.12 
 
 		 261 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  69.41 
 
 		 442 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  69.41 
 
 		 442 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2200  transposase IS605 OrfB  52.59 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2297  transposase IS605 OrfB  65.52 
 
 		 192 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294637  normal  0.708384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  73.91 
 
 		 461 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  68 
 
 		 267 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  58.24 
 
 		 420 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  72.55 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  70.59 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  70.59 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  68.63 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  70.59 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  68.63 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  68.63 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  72.5 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  70 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  70 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  49.32 
 
 		 440 aa  55.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  62.5 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  58.82 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  60 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1968  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  53.03 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.304604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  52.73 
 
 		 391 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  58.62 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  73.33 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  42.47 
 
 		 399 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1540  IS605 family transposase OrfB  45.65 
 
 		 223 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0597  transposase, IS605 OrfB family  30.43 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000997644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  35.62 
 
 		 369 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  35.62 
 
 		 369 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  35.62 
 
 		 369 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  35.62 
 
 		 369 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2633  transposase, IS605 OrfB family  30.43 
 
 		 372 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.56671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  35.62 
 
 		 369 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  37.8 
 
 		 399 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  37.8 
 
 		 399 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  55 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  47.62 
 
 		 393 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  47.62 
 
 		 393 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  54.05 
 
 		 405 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2454  transposase, IS605 OrfB family  30.43 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.1066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2438  transposase, IS605 OrfB family  30.43 
 
 		 391 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2156  transposase, IS605 OrfB family  30.43 
 
 		 393 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0601  transposase, IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 399 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000137299  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  47.06 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  42.62 
 
 		 405 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  46.3 
 
 		 409 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  50 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2849  transposase, IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 402 aa  43.5  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0628  transposase, IS605 OrfB family  32.31 
 
 		 411 aa  43.5  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4124  transposase  55.26 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0468  IS605 family transposase OrfB  47.37 
 
 		 299 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3084  IS605 family transposase OrfB  47.37 
 
 		 394 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5397  IS605 family transposase  50 
 
 		 385 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5017  IS605 family transposase  50 
 
 		 385 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1979  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  38.24 
 
 		 398 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0933201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3991  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 		 385 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3055  transposase, putative  44.9 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  45 
 
 		 395 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  44.74 
 
 		 394 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  48.65 
 
 		 293 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  47.37 
 
 		 387 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 		 385 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 		 398 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  45.45 
 
 		 363 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  43.48 
 
 		 398 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  43.48 
 
 		 398 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  43.59 
 
 		 382 aa  40.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3918  IS605 family transposase OrfB  52.63 
 
 		 385 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  44.74 
 
 		 390 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.68 
 
 		 402 aa  40  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1851  IS605 family transposase OrfB  41.25 
 
 		 384 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  39.34 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  40.62 
 
 		 410 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0641  IS605 family transposase OrfB  41.25 
 
 		 384 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133268  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  47.37 
 
 		 387 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>