80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0684 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  84.09 
 
 
190 aa  301  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  77.89 
 
 
197 aa  261  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  75.28 
 
 
193 aa  260  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  74.01 
 
 
202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  70.97 
 
 
194 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  78.88 
 
 
182 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  69.95 
 
 
203 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  60.11 
 
 
195 aa  223  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  79.75 
 
 
162 aa  221  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  58.7 
 
 
196 aa  209  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  61.29 
 
 
193 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  63.95 
 
 
295 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  48.17 
 
 
197 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  81.05 
 
 
116 aa  158  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  37.17 
 
 
204 aa  117  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  53.33 
 
 
126 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  34.74 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  37.81 
 
 
229 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  39.9 
 
 
229 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  33.53 
 
 
215 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  39.41 
 
 
229 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  32.8 
 
 
213 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  32.8 
 
 
213 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  32.09 
 
 
206 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  32.09 
 
 
206 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  64.29 
 
 
147 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34 
 
 
215 aa  95.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34 
 
 
215 aa  95.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 
192 aa  93.6  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  30.32 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  75 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  29.44 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 
192 aa  92.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  34.04 
 
 
209 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  33.15 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  34.72 
 
 
216 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  31.79 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  32.12 
 
 
209 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  35.42 
 
 
202 aa  87.8  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  32.02 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  35.26 
 
 
219 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  34.3 
 
 
219 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  30.67 
 
 
222 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  32.4 
 
 
193 aa  85.1  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  30.21 
 
 
201 aa  84.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  32.82 
 
 
209 aa  84.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  36.52 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  31.67 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  35.39 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  29.8 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  35.39 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  28.95 
 
 
201 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  34.83 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  61.9 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  32.22 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  32.31 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  31.79 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  30.73 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  33.71 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  32.58 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  29.37 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  26.98 
 
 
201 aa  74.3  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  33.15 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  31.12 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  30.61 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  27.03 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  27.03 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  33.82 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  70.59 
 
 
132 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  30.5 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  27.03 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  23.28 
 
 
201 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  37.14 
 
 
74 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 
74 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>