85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0122 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  96.76 
 
 		 216 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  93.98 
 
 		 216 aa  407  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  93.52 
 
 		 216 aa  407  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  92.59 
 
 		 216 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  90.28 
 
 		 244 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  51.69 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  49.52 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  48.06 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  48.06 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  45.15 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  45.12 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  43.84 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  44.65 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  44.65 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  48.21 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  46.73 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  44.62 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  45.64 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  44.62 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  45.13 
 
 		 192 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  43.59 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  43.65 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  43.65 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  40.72 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  39.9 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  39.9 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  38.66 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  35.42 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.18 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  37.89 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  37.81 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  41.44 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  36.41 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  36.41 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  38.97 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  41.12 
 
 		 191 aa  118  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  39.34 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  37.44 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  35.15 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  36.45 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  36.54 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  35.96 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  36.18 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  35.19 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  34.92 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  36.54 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  34.27 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  32.21 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  31.37 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  37.91 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  39.23 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  32.99 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  35.66 
 
 		 148 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  36 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  36 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  34.83 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  35.16 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  32.99 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  37.98 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  30.18 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  32.78 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  23.44 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  23.44 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  30.85 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  36.59 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  51.56 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  28.99 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  42.03 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  40.58 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  35.65 
 
 		 128 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  33.59 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  32.8 
 
 		 295 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  36.67 
 
 		 116 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  28.28 
 
 		 641 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0464  regulatory protein MerR  33.8 
 
 		 100 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.169334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  45 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>