79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3431 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  100 
 
 
197 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  80.68 
 
 
190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  76.47 
 
 
190 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  76.47 
 
 
190 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  70.56 
 
 
193 aa  249  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  77.91 
 
 
182 aa  249  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  67.02 
 
 
194 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  68.36 
 
 
202 aa  241  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  66.12 
 
 
203 aa  234  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  58.47 
 
 
195 aa  218  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  59.14 
 
 
193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  77.36 
 
 
162 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  58.15 
 
 
196 aa  209  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  47.64 
 
 
197 aa  170  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  60 
 
 
295 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  85.26 
 
 
116 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  36.76 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  38.12 
 
 
229 aa  104  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  37.62 
 
 
229 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  36.27 
 
 
215 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  36.27 
 
 
215 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 
222 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  37.62 
 
 
229 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  33.7 
 
 
213 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  33.7 
 
 
213 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  31.84 
 
 
215 aa  101  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  31.38 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  31.38 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  72.6 
 
 
147 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  35.64 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  32.12 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  46.72 
 
 
126 aa  91.7  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  32.22 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  31.09 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  33.88 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  31.09 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  32.45 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  31.91 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  33.71 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  30.57 
 
 
222 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  37.3 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  30.32 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  32.43 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  28.8 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  63.49 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  31.35 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  30.69 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  32.31 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  35.68 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  33.65 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  32.64 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  28.49 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  35.14 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  28.87 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  35.14 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  35.14 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  31.05 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  32.31 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  31.28 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  60.66 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  34.59 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  31.63 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  31.79 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  27.13 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  25.79 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  31.38 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  30.81 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  33.51 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  27.66 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  27.66 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  27.46 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  35.43 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  68.63 
 
 
132 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  30.22 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  40 
 
 
74 aa  48.5  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  38.57 
 
 
74 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>