159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0272 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  98.69 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  96.51 
 
 		 229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  72.52 
 
 		 222 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  51.06 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  51.6 
 
 		 195 aa  174  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  50.53 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  46.5 
 
 		 193 aa  171  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  47.34 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  47.45 
 
 		 194 aa  169  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  46.81 
 
 		 197 aa  167  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  47.45 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  47.5 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  40.83 
 
 		 222 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  45.12 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  40.83 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  47 
 
 		 193 aa  162  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  44.65 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  44.65 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  40.37 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  41.21 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  43.72 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  45.5 
 
 		 195 aa  158  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  45.12 
 
 		 216 aa  158  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  43.72 
 
 		 216 aa  158  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  45 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  41.31 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  42.79 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  43.6 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 213 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 213 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  40.95 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  42.65 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  40.84 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  41.36 
 
 		 207 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  40.28 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  40.28 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  44.5 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  36.63 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  36.68 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  38.24 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  36 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  38.54 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 201 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  37.37 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  33.5 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  33.5 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  34.21 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  37.19 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  37.19 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  37.25 
 
 		 196 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  32.52 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  38.8 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  39.25 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  36.54 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  38.59 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  42.45 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  29.21 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  36.23 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  39.86 
 
 		 148 aa  96.3  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  31.73 
 
 		 196 aa  95.9  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 		 182 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  37.91 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  35.35 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  41.98 
 
 		 162 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  26.5 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  37.98 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  25.5 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  33.56 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  44.44 
 
 		 63 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  38.54 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  34.38 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  45.28 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  49.25 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  28.3 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  37.68 
 
 		 74 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 74 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 269 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  32.18 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  28.83 
 
 		 128 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 150 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 97 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 119 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  26.25 
 
 		 551 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2555  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  30.72 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  38.36 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>