134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1000 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  40.1 
 
 
219 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  39.41 
 
 
222 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  39.06 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  41.33 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  39.58 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  38.97 
 
 
219 aa  138  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  38.42 
 
 
222 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  38.42 
 
 
209 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  36.92 
 
 
212 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  37.93 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  39.49 
 
 
215 aa  131  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  37.11 
 
 
213 aa  127  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  37.11 
 
 
213 aa  127  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  37.06 
 
 
195 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  36.41 
 
 
216 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  35.9 
 
 
216 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  35.53 
 
 
195 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  36.41 
 
 
216 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  36.41 
 
 
216 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  35.38 
 
 
216 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  34.87 
 
 
244 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  35 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  38.61 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  37.5 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  37.5 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  35.38 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  37.19 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  37.69 
 
 
229 aa  114  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  33.67 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  37.57 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  34.18 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  38.78 
 
 
195 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  32.98 
 
 
194 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  30.22 
 
 
190 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  35.24 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  33.85 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  33.85 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  38.69 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  33.51 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  31.28 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  33.85 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  31.53 
 
 
196 aa  94  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  29.15 
 
 
203 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  29.15 
 
 
203 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  31.44 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  36.69 
 
 
193 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  31.61 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  33.51 
 
 
195 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  30.46 
 
 
201 aa  92  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  29.44 
 
 
201 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  32.29 
 
 
195 aa  91.7  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  37.23 
 
 
196 aa  91.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  31.77 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  31.68 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  30.73 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  31.46 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  31.46 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  32.3 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.36 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  33.82 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  31.77 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  32.35 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  24.24 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  28.98 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 
504 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  37.36 
 
 
126 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  28.57 
 
 
116 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  29.69 
 
 
295 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  45.31 
 
 
79 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  32.67 
 
 
475 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 
185 aa  51.6  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  29.5 
 
 
474 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  37.29 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  44.23 
 
 
69 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0025  resolvase  39.51 
 
 
511 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.712822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  31.4 
 
 
515 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  30.28 
 
 
580 aa  48.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  39.66 
 
 
69 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  39.66 
 
 
69 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  37.7 
 
 
72 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  40.35 
 
 
75 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  34.15 
 
 
513 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  40.32 
 
 
71 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  44 
 
 
68 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  29.33 
 
 
641 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  44 
 
 
68 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  36.59 
 
 
512 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 
67 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  35 
 
 
69 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  41.18 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  43.14 
 
 
67 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  43.14 
 
 
69 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  43.14 
 
 
67 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>