115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1270 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  100 
 
 
195 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  36.02 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  38.67 
 
 
194 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  37.24 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  40.76 
 
 
193 aa  132  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  39.13 
 
 
192 aa  128  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  39.13 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  39.23 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  38.04 
 
 
193 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 
222 aa  122  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 
215 aa  122  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  34.74 
 
 
229 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  35.98 
 
 
213 aa  121  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  35.98 
 
 
213 aa  121  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  37.02 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  33.88 
 
 
208 aa  119  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  34.21 
 
 
229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  34.15 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  38.12 
 
 
191 aa  114  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  32.79 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  32.04 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  32.04 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  33.51 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  34.43 
 
 
201 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  33.53 
 
 
209 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  33.87 
 
 
219 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  32.83 
 
 
216 aa  104  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  32.09 
 
 
201 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 
216 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 
216 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  30.05 
 
 
201 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  33.16 
 
 
195 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  34.83 
 
 
216 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  31.72 
 
 
219 aa  101  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  32.11 
 
 
195 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  28.8 
 
 
203 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  28.8 
 
 
203 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  33.15 
 
 
244 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 
216 aa  99  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  32.04 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  32.58 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  33.71 
 
 
216 aa  94  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  32.42 
 
 
219 aa  92  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  33.51 
 
 
206 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  33.51 
 
 
206 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  32.11 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  28.57 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  30.43 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  30.43 
 
 
222 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  30.46 
 
 
222 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  29 
 
 
212 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  30.43 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  28.11 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  31.02 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  33.1 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  28.89 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  31.62 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  27.93 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  30.16 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  27.46 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  27.17 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  30.33 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  27.33 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  24.86 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  24.29 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  25.29 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  28.23 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  32.22 
 
 
295 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  47.37 
 
 
82 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  44.19 
 
 
79 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  29.21 
 
 
116 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  40.43 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 
68 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  47.37 
 
 
67 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  47.37 
 
 
64 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  47.37 
 
 
73 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  41.3 
 
 
69 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  47.37 
 
 
74 aa  45.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  47.37 
 
 
65 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  47.37 
 
 
79 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  41.3 
 
 
72 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  47.37 
 
 
72 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  47.37 
 
 
68 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 
207 aa  45.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 
79 aa  45.1  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  28 
 
 
128 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  47.37 
 
 
90 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  47.37 
 
 
88 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  32.29 
 
 
544 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  29.2 
 
 
513 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  30.88 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  42.5 
 
 
76 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  44.74 
 
 
75 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>