156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1118 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  98.69 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  96.07 
 
 		 229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  72.52 
 
 		 222 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  48 
 
 		 193 aa  175  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  47.74 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  50.53 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  51.06 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  50 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  46.81 
 
 		 202 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  47.45 
 
 		 192 aa  168  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  47.5 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  46.28 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  48.5 
 
 		 192 aa  165  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  45.12 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  45.12 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  41.71 
 
 		 201 aa  161  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  44.65 
 
 		 216 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  45.59 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  39.91 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  45.5 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  39.91 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  41.59 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  43.72 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  46 
 
 		 192 aa  158  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  45.12 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  43.72 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  39.45 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  42.41 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  44.08 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  41.36 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  41.79 
 
 		 209 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  43.13 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  40.48 
 
 		 216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  40.76 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  40.76 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  44.5 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  37.13 
 
 		 201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  37.75 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  36.68 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  39.06 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  36 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 201 aa  128  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  36.87 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  34 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  34 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  34.74 
 
 		 195 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  38.61 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  38.61 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  37.75 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  32.52 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  38.25 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  39.57 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  35.9 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  42.86 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  38.04 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  29.7 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  38.31 
 
 		 148 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  36.54 
 
 		 194 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 196 aa  94.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 		 182 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  37.91 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  35.35 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  26.63 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  25.5 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  38.46 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  33.56 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  42.86 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  39.39 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  35.16 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  45.28 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  27.43 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  49.25 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  37.68 
 
 		 74 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 74 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 269 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  32.03 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  32.18 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  28.83 
 
 		 128 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 150 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  36.84 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 119 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  41.1 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2555  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  26.88 
 
 		 551 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 97 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 97 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>