132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1911 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  81.11 
 
 
219 aa  361  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  79.63 
 
 
219 aa  358  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 
216 aa  185  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  49.76 
 
 
216 aa  185  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 
216 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 
216 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  49.76 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  49.03 
 
 
216 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  49.28 
 
 
244 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  44.91 
 
 
213 aa  169  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  44.91 
 
 
213 aa  169  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
215 aa  169  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  44.12 
 
 
208 aa  165  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  47.12 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  40.95 
 
 
229 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  40.48 
 
 
229 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  40 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  40.4 
 
 
197 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  41.33 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  41.33 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  39.42 
 
 
212 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  38.57 
 
 
222 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  40 
 
 
195 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  43.07 
 
 
192 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  44.27 
 
 
192 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  38.97 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  40.95 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  43.08 
 
 
193 aa  128  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  41.09 
 
 
194 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  38.62 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  41.15 
 
 
193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  35.68 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 
195 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  37.74 
 
 
222 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  37.26 
 
 
222 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
197 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  37.26 
 
 
222 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  37.26 
 
 
209 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  36.92 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34.45 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34.45 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  36.36 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  33.49 
 
 
203 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  33.49 
 
 
203 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
201 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  33.84 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  35.15 
 
 
201 aa  108  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  38.54 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  36.32 
 
 
201 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  32.83 
 
 
195 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  33.51 
 
 
209 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  36.22 
 
 
195 aa  98.6  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  29.47 
 
 
201 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  33.17 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  42.54 
 
 
204 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 
190 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 
190 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  33.33 
 
 
190 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  34.05 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  33.87 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  33.16 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  32.43 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  32.8 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  52.86 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  30.15 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  34 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  32.62 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  32.64 
 
 
148 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  21.95 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  22.44 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  30.38 
 
 
295 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
68 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  26.12 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  26.87 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  45 
 
 
137 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  41.38 
 
 
67 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  43.33 
 
 
73 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  44.64 
 
 
75 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 
74 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  43.14 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  43.4 
 
 
87 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  48.89 
 
 
69 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  42.59 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  39.71 
 
 
79 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  42.62 
 
 
72 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 
64 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  44.23 
 
 
68 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  30.99 
 
 
74 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 
303 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  44 
 
 
65 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  44 
 
 
88 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  30.99 
 
 
74 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  30.72 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  44 
 
 
90 aa  45.1  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3574  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  32.88 
 
 
147 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>