28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1426 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  74.14 
 
 		 197 aa  90.5  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  65 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  59.02 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  56.25 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  70 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  70 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  65.45 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  59.09 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  65.31 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  69.57 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  69.57 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  67.39 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  67.39 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  67.39 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  66.67 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  52.83 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  73.33 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  38.18 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  36.67 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  32.31 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  35.85 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  34.25 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  33.93 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  33.93 
 
 		 215 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  33.93 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>