105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0658 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  98.93 
 
 
209 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  82.99 
 
 
197 aa  342  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  52.38 
 
 
219 aa  223  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  56.22 
 
 
201 aa  219  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 
201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  46.11 
 
 
203 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  46.11 
 
 
203 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  55.92 
 
 
148 aa  168  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  41 
 
 
201 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  44.04 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  40.76 
 
 
229 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  98.65 
 
 
74 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  40.28 
 
 
229 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  39.69 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  39.34 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  93.24 
 
 
74 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  36.19 
 
 
222 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  36.84 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  37.32 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  38.83 
 
 
215 aa  132  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  39.9 
 
 
216 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  39.9 
 
 
216 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  39.32 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  37.8 
 
 
216 aa  128  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  37.86 
 
 
216 aa  127  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  38.97 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  36.89 
 
 
213 aa  125  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  36.89 
 
 
213 aa  125  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  36.87 
 
 
219 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  38.42 
 
 
216 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  34.76 
 
 
222 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  35.23 
 
 
195 aa  121  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  37.38 
 
 
244 aa  121  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  34.38 
 
 
195 aa  121  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  31.82 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  35.26 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  34.29 
 
 
222 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  34.45 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  31.31 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  34.91 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  37.5 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  37.5 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  33.81 
 
 
222 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  38.14 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  34.65 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  34.93 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  38.74 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  37.7 
 
 
192 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  36.65 
 
 
192 aa  115  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  37.17 
 
 
195 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  32.04 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  35.26 
 
 
193 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  41.78 
 
 
197 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  41.04 
 
 
196 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  36.13 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  34.21 
 
 
195 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  31.34 
 
 
212 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  33.87 
 
 
190 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  36.22 
 
 
197 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  34.78 
 
 
193 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  37.86 
 
 
202 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  41.04 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  37.59 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  36.57 
 
 
193 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  31.22 
 
 
196 aa  88.6  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 
190 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 
190 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  36.09 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  34.4 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  32.35 
 
 
116 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  36.72 
 
 
295 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  38.1 
 
 
63 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  28.24 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  35.8 
 
 
128 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  35.44 
 
 
484 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  35.44 
 
 
484 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  33.59 
 
 
476 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  43.28 
 
 
126 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.23 
 
 
475 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  44.62 
 
 
94 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  46.94 
 
 
707 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  24.65 
 
 
551 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  31.73 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  47.62 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  29.71 
 
 
343 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  38.6 
 
 
64 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 
474 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  26 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  44.68 
 
 
67 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 
295 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
273 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>