100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0941 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  47.4 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  44.85 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  42.64 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  43.01 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  43.01 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  43.01 
 
 		 229 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  39.49 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  37.95 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  37.95 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  37.63 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34.02 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  35.98 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34.02 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  34.83 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  35.48 
 
 		 192 aa  125  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  36.56 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  35.18 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  35.18 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  35.32 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  38.92 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  35.48 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  34.47 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  35.64 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  35.26 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  34.18 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  92.06 
 
 		 63 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  33.87 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  34.41 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  32.98 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  33.67 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  34.95 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  33.98 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  34.41 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  34.17 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  34.04 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  34.04 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  35.39 
 
 		 222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  35.05 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  33.53 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  32.6 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  35.03 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  35.15 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  38.41 
 
 		 196 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  39.13 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  33.87 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  28.02 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  30 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  29.19 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  29.19 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  32.23 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  32.8 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  32.8 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  30.6 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  35.04 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  28.8 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.99 
 
 		 148 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  30.56 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  29.35 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  68.52 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  27.42 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  27.03 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  29.55 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  24.34 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  25.82 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  26.46 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  26.98 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  34.58 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  29.7 
 
 		 116 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4123  OrfB family transposase  56 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00660809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  36.23 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  28.57 
 
 		 295 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  32.56 
 
 		 522 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  27.1 
 
 		 563 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  32.56 
 
 		 415 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2603  putative resolvase  27.59 
 
 		 589 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00221459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  29.92 
 
 		 496 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  31.78 
 
 		 515 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  27.06 
 
 		 147 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  29.25 
 
 		 554 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 494 aa  45.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.82 
 
 		 517 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  32.1 
 
 		 504 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  35 
 
 		 519 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.62 
 
 		 274 aa  42.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  35.23 
 
 		 484 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  35.23 
 
 		 484 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  33.33 
 
 		 523 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  22.14 
 
 		 537 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  32.1 
 
 		 523 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  45.24 
 
 		 295 aa  41.6  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  28.46 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>