86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2513 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  60 
 
 
196 aa  235  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  56.7 
 
 
193 aa  214  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  60 
 
 
190 aa  214  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  60.23 
 
 
190 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  60.23 
 
 
190 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  51.28 
 
 
197 aa  208  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  58.48 
 
 
197 aa  205  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  53.4 
 
 
194 aa  201  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  54.49 
 
 
193 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  54.35 
 
 
203 aa  191  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  55.06 
 
 
202 aa  188  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  57.41 
 
 
182 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  62.22 
 
 
162 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  43.39 
 
 
204 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  47.98 
 
 
295 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  38.27 
 
 
213 aa  125  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  38.27 
 
 
213 aa  125  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  36.73 
 
 
215 aa  123  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  63.74 
 
 
116 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  38.14 
 
 
222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  37.11 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  35.38 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  37.11 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  38.8 
 
 
229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  36.6 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  38.78 
 
 
206 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  38.78 
 
 
206 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  38.25 
 
 
229 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  47.11 
 
 
126 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  44.93 
 
 
229 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  37.43 
 
 
192 aa  101  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  31.91 
 
 
207 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
208 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  36.9 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34.21 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34.21 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  36.22 
 
 
216 aa  98.6  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  36.73 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  35.23 
 
 
219 aa  98.2  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  37.36 
 
 
216 aa  97.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  36.27 
 
 
219 aa  97.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  39.23 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  37.91 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  37.91 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  36.81 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  36.9 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  32.4 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 
197 aa  95.5  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  32.45 
 
 
208 aa  94.7  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 
195 aa  94  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  32.45 
 
 
208 aa  92.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  37.57 
 
 
193 aa  92  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  32.64 
 
 
202 aa  91.7  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  35.45 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  36.26 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  36.17 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 
244 aa  89.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  32 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  37.86 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  33.88 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  30.11 
 
 
209 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  40.15 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  36.9 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  65 
 
 
81 aa  82  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  27.68 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  29.69 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  56.16 
 
 
147 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  31.02 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  32.61 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  28.57 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  28.57 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  32.28 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  62.5 
 
 
132 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  23.3 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  35.59 
 
 
74 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0464  regulatory protein MerR  30.14 
 
 
100 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.169334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2921  transposase, IS605 OrfB  40.35 
 
 
249 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0840725 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 
74 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  23.31 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  23.93 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  31.25 
 
 
205 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 
210 aa  41.2  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  30.5 
 
 
219 aa  41.2  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>