116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0842 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  51.94 
 
 
213 aa  205  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  51.94 
 
 
213 aa  205  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  49.03 
 
 
215 aa  198  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  40.19 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  39.52 
 
 
219 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  40.95 
 
 
216 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  38.61 
 
 
192 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  39.47 
 
 
192 aa  122  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  36.76 
 
 
194 aa  119  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  35.23 
 
 
208 aa  119  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  37.89 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  37.37 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  33.17 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  34.72 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  37.17 
 
 
193 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  36.98 
 
 
193 aa  112  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  37.13 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  37.13 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  31.73 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  36.06 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  35.05 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  31.73 
 
 
229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  35.05 
 
 
216 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
208 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  34.58 
 
 
244 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  31.73 
 
 
229 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  37.37 
 
 
191 aa  106  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  36.63 
 
 
216 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  31.77 
 
 
207 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  31.22 
 
 
215 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  31.22 
 
 
215 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  34.59 
 
 
202 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  35.43 
 
 
197 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  31.53 
 
 
206 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  31.53 
 
 
206 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  30.65 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  33.94 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  37.58 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  37.58 
 
 
207 aa  92.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  34.34 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  31.75 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  30.27 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  34.64 
 
 
209 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  34.81 
 
 
222 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  26.88 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  34.18 
 
 
222 aa  88.6  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  30.66 
 
 
222 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  32.61 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  30 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  29.35 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  34.23 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  26.89 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  30.5 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  30.5 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  26.47 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  26.47 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  31.91 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  24.88 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  30.22 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  27.86 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  31.51 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  29.01 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  29.86 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  33.71 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  33.71 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  24.14 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  34.86 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  45.76 
 
 
94 aa  55.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  29.41 
 
 
295 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  28.68 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  35.62 
 
 
137 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  26.23 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  39.76 
 
 
515 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  38.75 
 
 
540 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 
504 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  27.59 
 
 
526 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  28.57 
 
 
63 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4306  hypothetical protein  48 
 
 
70 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  37.68 
 
 
126 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  29.9 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  30.3 
 
 
217 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  38.75 
 
 
546 aa  45.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  35.8 
 
 
522 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  40.74 
 
 
67 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  41.51 
 
 
64 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  31.43 
 
 
485 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  36.36 
 
 
65 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2705  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
75 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  39.62 
 
 
73 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  27.85 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  28.33 
 
 
539 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  35.8 
 
 
415 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  38.89 
 
 
68 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  25 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  38.89 
 
 
79 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2733  Resolvase domain protein  25 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>