154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1238 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  76.3 
 
 		 217 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  67.62 
 
 		 218 aa  298  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  67.62 
 
 		 218 aa  298  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  67.14 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  67.14 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  67.14 
 
 		 218 aa  295  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  67.14 
 
 		 218 aa  295  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  67.14 
 
 		 218 aa  295  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  67.14 
 
 		 218 aa  294  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  67.14 
 
 		 218 aa  294  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  67.14 
 
 		 218 aa  294  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  67.14 
 
 		 218 aa  294  7e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  50.68 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  31.33 
 
 		 515 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.78 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2733  Resolvase domain protein  31.68 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  28.9 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.91 
 
 		 494 aa  58.9  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  27.31 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  27.31 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  28.95 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  30.81 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  31.71 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  31.71 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  33.99 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  27.23 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.32 
 
 		 551 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.45 
 
 		 462 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  25.49 
 
 		 590 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 579 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.22 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.32 
 
 		 546 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.49 
 
 		 540 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.52 
 
 		 515 aa  51.6  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  29.57 
 
 		 460 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  28.21 
 
 		 494 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1522  Resolvase domain protein  29.7 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000803569  hitchhiker  0.003356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1941  putative site-specific recombinase, resolvase family  25.11 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.292978  normal  0.0530197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.5 
 
 		 475 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  24.84 
 
 		 377 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.37 
 
 		 504 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0738  resolvase domain-containing protein  27.85 
 
 		 261 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0136169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  25.26 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  28.39 
 
 		 511 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  26.87 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  26.05 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  30.99 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.66 
 
 		 563 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  27.22 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.49 
 
 		 565 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.4 
 
 		 522 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1994  resolvase  27.85 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.854383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  23.03 
 
 		 561 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  34.75 
 
 		 544 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.62 
 
 		 665 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  25.94 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  29.25 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  29.25 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.74 
 
 		 561 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  26.97 
 
 		 534 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  29.27 
 
 		 380 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  26.49 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  41.86 
 
 		 689 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  41.86 
 
 		 689 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  29.51 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.45 
 
 		 547 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  26.8 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  26.8 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  26.8 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  32.81 
 
 		 467 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  29.23 
 
 		 522 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  38.27 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  25.81 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  29.58 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  25.74 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  26.17 
 
 		 546 aa  45.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2033  resolvase domain-containing protein  26.58 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  29.23 
 
 		 488 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  37.74 
 
 		 460 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 		 415 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2045  resolvase family site-specific recombinase  26.58 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2201  resolvase family site-specific recombinase  26.58 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  25.25 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  25.64 
 
 		 521 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.94 
 
 		 553 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  26.5 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.7 
 
 		 540 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  26.5 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 531 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 		 522 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  27.27 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  26 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  29.08 
 
 		 534 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  32.09 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.66 
 
 		 554 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.21 
 
 		 613 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>