47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2733 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2733  Resolvase domain protein  100 
 
 		 126 aa  259  8.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1522  Resolvase domain protein  57.39 
 
 		 234 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000803569  hitchhiker  0.003356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  32.04 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  31.68 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  32.71 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  32.71 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  32.71 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  33 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  32.32 
 
 		 539 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  33 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  31.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  31.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  31.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  31.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  30.84 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  31.58 
 
 		 515 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  26.92 
 
 		 525 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  30.49 
 
 		 213 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  30.63 
 
 		 565 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  30.49 
 
 		 213 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  26.92 
 
 		 539 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  26.92 
 
 		 568 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  30.3 
 
 		 511 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  29.91 
 
 		 336 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  30.11 
 
 		 550 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  29.91 
 
 		 576 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  33.9 
 
 		 475 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  28.97 
 
 		 542 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  27.1 
 
 		 532 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.03 
 
 		 562 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  29.29 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.55 
 
 		 542 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.55 
 
 		 542 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.55 
 
 		 542 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.75 
 
 		 529 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.1 
 
 		 578 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  29.09 
 
 		 518 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  28.83 
 
 		 549 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.45 
 
 		 549 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  28.7 
 
 		 522 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.1 
 
 		 569 aa  41.2  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  27.78 
 
 		 522 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  29.46 
 
 		 526 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.03 
 
 		 521 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>