267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07990 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  100 
 
 		 529 aa  1076    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  32.09 
 
 		 501 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  30.62 
 
 		 488 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  27.67 
 
 		 479 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  27.67 
 
 		 479 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  31.35 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  30.79 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  29.72 
 
 		 465 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  31.63 
 
 		 460 aa  130  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  25.4 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  32.52 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  26.81 
 
 		 522 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  32.78 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  28.91 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  27.29 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  27.72 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  28.57 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  27.07 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  28.57 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  28.57 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  26.68 
 
 		 497 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  31.49 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  31.49 
 
 		 460 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  24.53 
 
 		 485 aa  96.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  27.22 
 
 		 385 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.26 
 
 		 515 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  27.3 
 
 		 452 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.99 
 
 		 506 aa  87.8  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.15 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  25.44 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  22.16 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.81 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  20.25 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.57 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  26.94 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.71 
 
 		 540 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.77 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  22.28 
 
 		 526 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.52 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  24.68 
 
 		 503 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.37 
 
 		 447 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.96 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.38 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  22.74 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.03 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  26.14 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.03 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.65 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.61 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  25.57 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.08 
 
 		 561 aa  77  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  21.07 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  21.37 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  26.01 
 
 		 429 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  20.26 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  28.71 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.25 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.07 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  21.02 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4146  Recombinase  26.65 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.07 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.07 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.79 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.07 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.24 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.11 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  22.78 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.56 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  20.5 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  26 
 
 		 665 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.79 
 
 		 534 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.39 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  21.71 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  27.6 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.21 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  22.22 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.26 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  20 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  22.31 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.79 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  29.11 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.97 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  21.21 
 
 		 603 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  20.57 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  24.68 
 
 		 542 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.79 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4085  hypothetical protein  37.27 
 
 		 136 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  20.87 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  25.46 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  23.87 
 
 		 515 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  20.25 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  20.25 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.1 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  23.1 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  20.98 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.86 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  20.25 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>