179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4124 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  94.63 
 
 		 335 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  100 
 
 		 432 aa  875    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  38.6 
 
 		 501 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  37.21 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  34.69 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  28.51 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  28.51 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.51 
 
 		 529 aa  132  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  27.79 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  28.83 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  28.83 
 
 		 467 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  28.6 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  28.47 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  30.24 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  26.32 
 
 		 460 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  27.63 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  27.29 
 
 		 484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  29.96 
 
 		 460 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  27.42 
 
 		 460 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  24.89 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.99 
 
 		 539 aa  97.8  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  26.19 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  26.19 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  26.19 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.62 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.79 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  25.27 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.06 
 
 		 458 aa  87.4  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  27.08 
 
 		 522 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.59 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  25.4 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  33.14 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4085  hypothetical protein  97.22 
 
 		 136 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.13 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  28.9 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  22.96 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.71 
 
 		 534 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  20.44 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25.35 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.44 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.45 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.76 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  25.75 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  25.34 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.35 
 
 		 613 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.53 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4146  Recombinase  28.21 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.04 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  23.59 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.22 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.91 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  29.34 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.87 
 
 		 534 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  22.86 
 
 		 504 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.87 
 
 		 537 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.26 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  24.85 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  22.74 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.17 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.52 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.52 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  22.36 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.62 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.62 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  23.55 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  23.33 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.35 
 
 		 665 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  22.4 
 
 		 515 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.62 
 
 		 542 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.87 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  28.14 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  19.25 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  22.52 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  20.87 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  25.47 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  23.78 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.78 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  25.37 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  23.37 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  26.59 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.08 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4164  hypothetical protein  23.93 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  27.72 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.98 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.42 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.42 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  26.06 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2108  hypothetical protein  24.43 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0876721  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.05 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  26.13 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  30.38 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  22.91 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.81 
 
 		 544 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  20.97 
 
 		 519 aa  57  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  29.65 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  26.01 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  20.8 
 
 		 521 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>