247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2519 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  100 
 
 
494 aa  970    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  39.68 
 
 
488 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  39.63 
 
 
460 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  39.63 
 
 
460 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  36.61 
 
 
467 aa  239  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  35.19 
 
 
460 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  45.07 
 
 
484 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  35.21 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  35.21 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  35.21 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  35.9 
 
 
460 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  37.18 
 
 
460 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  34.49 
 
 
465 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  33.84 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  33.84 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  32.99 
 
 
522 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  33.95 
 
 
467 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  31.88 
 
 
500 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  35.07 
 
 
461 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.18 
 
 
539 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  32.48 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  29.73 
 
 
503 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.34 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.96 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  29.41 
 
 
506 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.22 
 
 
529 aa  118  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  36.06 
 
 
385 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.93 
 
 
569 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  31.49 
 
 
501 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  26.72 
 
 
494 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21.85 
 
 
542 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21.85 
 
 
542 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  21.85 
 
 
542 aa  87  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.14 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  31.37 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.99 
 
 
555 aa  84.7  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.99 
 
 
550 aa  84.7  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.4 
 
 
558 aa  83.6  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  28.71 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25.29 
 
 
441 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  32.63 
 
 
515 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.96 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.57 
 
 
475 aa  77  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  22.86 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  27.27 
 
 
462 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.03 
 
 
485 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 
445 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
441 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  26.33 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.71 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.73 
 
 
558 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  26.49 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.99 
 
 
613 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  28.75 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4164  hypothetical protein  25.88 
 
 
501 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.59 
 
 
511 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.37 
 
 
462 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  25.53 
 
 
707 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  23 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0567  Resolvase domain protein  29.84 
 
 
577 aa  71.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.08 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.75 
 
 
510 aa  70.9  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.57 
 
 
537 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  26.87 
 
 
546 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  21 
 
 
526 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  27.31 
 
 
520 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.38 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.38 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  21 
 
 
532 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.5 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.06 
 
 
534 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.5 
 
 
534 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  19.78 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.76 
 
 
562 aa  68.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  22.95 
 
 
500 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  26.92 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  28.76 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.31 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  26.5 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.8 
 
 
522 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.44 
 
 
569 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  22.57 
 
 
542 aa  66.6  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  22.57 
 
 
554 aa  66.6  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25 
 
 
544 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  20.37 
 
 
504 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.22 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.83 
 
 
447 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.22 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.75 
 
 
506 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.82 
 
 
534 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  22.38 
 
 
603 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  26.8 
 
 
549 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
281 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.89 
 
 
484 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.89 
 
 
484 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.22 
 
 
527 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.65 
 
 
479 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.94 
 
 
537 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  26.67 
 
 
550 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>