More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2143 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  100 
 
 		 504 aa  1037    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  45.05 
 
 		 517 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  42.94 
 
 		 515 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  42.16 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  35.16 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  35.16 
 
 		 516 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  34.19 
 
 		 515 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  30.83 
 
 		 501 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  29.88 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  30.47 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  26.01 
 
 		 535 aa  114  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.59 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  30.56 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.8 
 
 		 484 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.8 
 
 		 484 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  22.57 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.5 
 
 		 524 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.2 
 
 		 586 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.32 
 
 		 558 aa  104  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  22.51 
 
 		 498 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 537 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.01 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.63 
 
 		 462 aa  96.7  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  28.78 
 
 		 511 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25 
 
 		 544 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  24.44 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  28.68 
 
 		 421 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.3 
 
 		 539 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23.31 
 
 		 485 aa  95.1  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.97 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  21.26 
 
 		 515 aa  93.2  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  20.39 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.11 
 
 		 515 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.66 
 
 		 415 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  23.8 
 
 		 513 aa  91.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25 
 
 		 546 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  22.84 
 
 		 540 aa  90.9  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24.26 
 
 		 479 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.84 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.24 
 
 		 517 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.1 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.88 
 
 		 542 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.88 
 
 		 542 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.88 
 
 		 542 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.18 
 
 		 488 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  23.97 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  20.54 
 
 		 532 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  22.32 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.19 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.22 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  22.82 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.96 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  21.88 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.2 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.73 
 
 		 546 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.47 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  24.04 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.51 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  21.81 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  20.33 
 
 		 552 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  25.6 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  23.02 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.4 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  21.12 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  21.74 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  21.12 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  19.07 
 
 		 665 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.28 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  23.6 
 
 		 694 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  23.6 
 
 		 694 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  23.6 
 
 		 694 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  23.6 
 
 		 694 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  23.6 
 
 		 694 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  21.7 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  22.36 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  22.86 
 
 		 579 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.36 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  23.93 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  20.74 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  20.4 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  20.74 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.43 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  22.58 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.56 
 
 		 553 aa  76.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  24.34 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  19.73 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  21.62 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  22.08 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  19.15 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.82 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  21.41 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  20.55 
 
 		 569 aa  73.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  23.2 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  22.18 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  22.22 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  22.3 
 
 		 526 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  21.15 
 
 		 545 aa  72.8  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  21.41 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  22.95 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>