256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20310 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  93.89 
 
 		 458 aa  874    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  100 
 
 		 458 aa  924    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  32.7 
 
 		 467 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  34.58 
 
 		 469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  34.58 
 
 		 469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  34.58 
 
 		 469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  30.98 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  32.83 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 460 aa  156  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  30.18 
 
 		 488 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  31.22 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  30.17 
 
 		 460 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  29.96 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  28.66 
 
 		 479 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  28.66 
 
 		 479 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  29.76 
 
 		 494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.75 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.57 
 
 		 569 aa  109  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  29.73 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.36 
 
 		 539 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  30.57 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.91 
 
 		 546 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.06 
 
 		 506 aa  96.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  28.67 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.13 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21.94 
 
 		 542 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21.94 
 
 		 542 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  21.94 
 
 		 542 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.03 
 
 		 521 aa  93.6  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  29.34 
 
 		 467 aa  93.2  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25.99 
 
 		 500 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  30 
 
 		 500 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 547 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  26.79 
 
 		 432 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.21 
 
 		 485 aa  90.1  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  26.17 
 
 		 500 aa  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.31 
 
 		 519 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.25 
 
 		 519 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.6 
 
 		 546 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  31.25 
 
 		 497 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  28.12 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  25.35 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25 
 
 		 544 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.24 
 
 		 520 aa  87  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.49 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.83 
 
 		 521 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.28 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.4 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.91 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.21 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.91 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  29.02 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  21.36 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.17 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.61 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.89 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.33 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.14 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  26.91 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  26.75 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.42 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.62 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  28.36 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  23.7 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  23.43 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  27.48 
 
 		 545 aa  77  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  24.38 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.63 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.99 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.47 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  24.38 
 
 		 550 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  22.34 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  23.87 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.27 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  25.81 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  25.76 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.46 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  23.99 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  24.06 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.54 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  22.6 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  22.33 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  25.15 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.56 
 
 		 529 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.17 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  25.88 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.32 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  24 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  26.17 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  22.59 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  25.35 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.26 
 
 		 551 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  27.38 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  31.9 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.7 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.44 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.86 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.44 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  26.41 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>