286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5572 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  100 
 
 
479 aa  965    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  100 
 
 
479 aa  965    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  47.1 
 
 
467 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  47.08 
 
 
461 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  36.29 
 
 
460 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  34.39 
 
 
467 aa  220  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  35.5 
 
 
460 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  30.26 
 
 
460 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  32.36 
 
 
488 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  39.15 
 
 
484 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  44.64 
 
 
460 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  33.89 
 
 
465 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  44.29 
 
 
460 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  34.09 
 
 
385 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  32.56 
 
 
497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  32.77 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  32.77 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  32.77 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  32.68 
 
 
494 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.67 
 
 
529 aa  134  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  28.51 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  27.52 
 
 
412 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.09 
 
 
458 aa  126  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.66 
 
 
458 aa  126  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  27.68 
 
 
501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  27.69 
 
 
500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  30.18 
 
 
522 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  24.17 
 
 
506 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.92 
 
 
511 aa  113  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  29.7 
 
 
534 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.18 
 
 
550 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.18 
 
 
555 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25.2 
 
 
558 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  26.76 
 
 
503 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  28.61 
 
 
534 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.36 
 
 
537 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.11 
 
 
534 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.81 
 
 
561 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.36 
 
 
547 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28.36 
 
 
534 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.36 
 
 
534 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.52 
 
 
569 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.7 
 
 
475 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.11 
 
 
534 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.08 
 
 
539 aa  100  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.96 
 
 
537 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 
537 aa  98.2  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  24.85 
 
 
494 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.99 
 
 
542 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.24 
 
 
554 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.01 
 
 
484 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.27 
 
 
447 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.06 
 
 
515 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.01 
 
 
484 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.26 
 
 
485 aa  90.5  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.66 
 
 
482 aa  90.1  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.18 
 
 
540 aa  89.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  24.44 
 
 
526 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.42 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.66 
 
 
542 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.66 
 
 
542 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.66 
 
 
542 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.25 
 
 
504 aa  87  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 
548 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  27 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  23.41 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  24.64 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  22.73 
 
 
475 aa  84  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  27.39 
 
 
417 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.66 
 
 
521 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  24.85 
 
 
511 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  27.19 
 
 
500 aa  82.4  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.59 
 
 
558 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.42 
 
 
546 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.41 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.38 
 
 
579 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.75 
 
 
517 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  26.46 
 
 
549 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  21.33 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  21.34 
 
 
519 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  29.56 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  20.47 
 
 
534 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23.96 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  23.03 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  25.62 
 
 
622 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  22.09 
 
 
522 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.33 
 
 
506 aa  80.1  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.23 
 
 
555 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  21.79 
 
 
429 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.71 
 
 
613 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  22.06 
 
 
500 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.03 
 
 
494 aa  79  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  23.82 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  21.64 
 
 
606 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.27 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>