190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3143 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  100 
 
 		 622 aa  1285    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  34.58 
 
 		 644 aa  286  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  35.78 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  35.75 
 
 		 590 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  39.25 
 
 		 544 aa  261  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  35.62 
 
 		 565 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  33.78 
 
 		 563 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  31.03 
 
 		 585 aa  223  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  37.07 
 
 		 545 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  31.97 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  34.96 
 
 		 560 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  30.19 
 
 		 571 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  32.79 
 
 		 508 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  32.79 
 
 		 508 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  31.67 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  30.61 
 
 		 539 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  29.64 
 
 		 550 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  31.12 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  32.28 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  29.73 
 
 		 681 aa  160  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  28.75 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  28.67 
 
 		 503 aa  133  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  28.22 
 
 		 534 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  27.29 
 
 		 525 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  27.16 
 
 		 506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  26.09 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.5 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  23.68 
 
 		 569 aa  89.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 		 537 aa  86.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.88 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.5 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  25.62 
 
 		 479 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  25.62 
 
 		 479 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.83 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  26.51 
 
 		 548 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.8 
 
 		 498 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.1 
 
 		 565 aa  77  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  26.28 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.74 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  24.73 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  24.77 
 
 		 442 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  37.31 
 
 		 548 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.85 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  22.32 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  21.54 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.2 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.2 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.2 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.97 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  23.62 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.37 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.15 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  27 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.81 
 
 		 519 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.07 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  24.21 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  31.05 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  29.55 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.33 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  20.99 
 
 		 551 aa  67  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.27 
 
 		 504 aa  67  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.31 
 
 		 519 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.92 
 
 		 494 aa  67  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  22.67 
 
 		 662 aa  66.6  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.77 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  25.67 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  27.27 
 
 		 561 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  26.78 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  23.33 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.77 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.18 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  23.11 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  24.05 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  22.36 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  30.3 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.85 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  24.16 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  31.07 
 
 		 540 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  31.49 
 
 		 590 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  25 
 
 		 460 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  22.87 
 
 		 516 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.93 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.66 
 
 		 517 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.93 
 
 		 484 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.88 
 
 		 515 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  22.65 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  23.76 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  22.92 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  22.76 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.24 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  22 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  23.58 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  24.55 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.21 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.87 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  26.52 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  23.82 
 
 		 576 aa  60.1  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.87 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>