170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0107 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  100 
 
 		 544 aa  1120    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  37.03 
 
 		 590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  43.54 
 
 		 644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  42.82 
 
 		 509 aa  286  9e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  36.97 
 
 		 585 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  39.25 
 
 		 622 aa  261  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  37.8 
 
 		 565 aa  246  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  37.61 
 
 		 545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  33.64 
 
 		 563 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  28.98 
 
 		 526 aa  193  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  33.73 
 
 		 589 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  31.24 
 
 		 681 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  32.69 
 
 		 508 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  32.69 
 
 		 508 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  27.64 
 
 		 560 aa  171  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  34.53 
 
 		 571 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  27.8 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  25.53 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  28.63 
 
 		 503 aa  147  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  25.73 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  30.75 
 
 		 540 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  27.74 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  28.54 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  26.5 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  25.7 
 
 		 548 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  27.95 
 
 		 534 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  27.27 
 
 		 601 aa  94  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  31.07 
 
 		 534 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  30.47 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  30.15 
 
 		 534 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  29.59 
 
 		 534 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  30.15 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  29.85 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.85 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.22 
 
 		 540 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  29.59 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.3 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.73 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.39 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  25.71 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  22.92 
 
 		 551 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.02 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  24.41 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  24.52 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.34 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  23.31 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  25.27 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.89 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.7 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 		 590 aa  67.4  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.26 
 
 		 526 aa  67  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 		 519 aa  67  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.44 
 
 		 523 aa  67  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  24.2 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.52 
 
 		 496 aa  66.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  23.65 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  22.29 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.26 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  24.4 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.35 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  24.75 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  24.75 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.34 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.33 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.16 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.34 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.62 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  24.8 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  26.89 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  22.12 
 
 		 498 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.54 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.47 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  23.83 
 
 		 550 aa  62  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  24.3 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  22.86 
 
 		 500 aa  62  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.52 
 
 		 429 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.34 
 
 		 521 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  22.16 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.1 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  22.96 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.1 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  22.64 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.14 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  24.36 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  22.96 
 
 		 484 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.13 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  23.27 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  21.53 
 
 		 543 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  22.4 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.93 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  22.01 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.79 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.7 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.97 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  23.88 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.46 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  24.43 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>