159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0003 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  100 
 
 		 509 aa  1036    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  42.82 
 
 		 544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  38.44 
 
 		 644 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  35.78 
 
 		 622 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  38.67 
 
 		 590 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  34.11 
 
 		 565 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  34.19 
 
 		 585 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  33.6 
 
 		 563 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  35.33 
 
 		 545 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  33.95 
 
 		 589 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  30.65 
 
 		 571 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  32.02 
 
 		 508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  32.02 
 
 		 508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  30.28 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  30.63 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  28.13 
 
 		 681 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  27.98 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  28.87 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  28.48 
 
 		 539 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  31.5 
 
 		 541 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  26.49 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  30.18 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  28.68 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  27 
 
 		 548 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  26.22 
 
 		 532 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  25.77 
 
 		 601 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  28.25 
 
 		 534 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  24.67 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.37 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  21.79 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  23.28 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  26.51 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  24.46 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  26.17 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.67 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  28.04 
 
 		 561 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  23.81 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  31.33 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.8 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  24.22 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.48 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.21 
 
 		 613 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.05 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  22.93 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  24.07 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.07 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.44 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.44 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.44 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  28.72 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  23.08 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  22.54 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.65 
 
 		 562 aa  63.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.28 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  22.28 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  23.1 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  21.28 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  22.65 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  24.4 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  28.31 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  22.6 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  23.47 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  23.49 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.72 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  23.53 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  21.74 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  22.04 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.22 
 
 		 521 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  24.92 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  22.36 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  30.99 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.76 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.82 
 
 		 569 aa  57  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  22.22 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  30.39 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.3 
 
 		 565 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  28.18 
 
 		 336 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.05 
 
 		 523 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.19 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  33.33 
 
 		 251 aa  55.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.99 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.92 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  20.38 
 
 		 537 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  21.09 
 
 		 539 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.08 
 
 		 506 aa  53.9  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  26.8 
 
 		 549 aa  54.3  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.22 
 
 		 523 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.75 
 
 		 546 aa  53.9  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.66 
 
 		 552 aa  53.5  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  23.19 
 
 		 519 aa  53.5  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  22.32 
 
 		 612 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  21.16 
 
 		 551 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  24.47 
 
 		 279 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  22.19 
 
 		 542 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  21.57 
 
 		 539 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  24.72 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>