39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0490 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  100 
 
 		 681 aa  1398    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  33.91 
 
 		 644 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  28.78 
 
 		 590 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  31.24 
 
 		 544 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  33.59 
 
 		 565 aa  194  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  29.75 
 
 		 563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  29.72 
 
 		 622 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  27.51 
 
 		 589 aa  167  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  27.95 
 
 		 585 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  27.98 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  29.17 
 
 		 545 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  26.29 
 
 		 571 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  28.5 
 
 		 508 aa  124  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  28.5 
 
 		 508 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  25.31 
 
 		 503 aa  113  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  25.1 
 
 		 560 aa  111  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  25.09 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  24.43 
 
 		 539 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  25.87 
 
 		 550 aa  94.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  24.72 
 
 		 526 aa  92.8  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  33.12 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  29.29 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  24.47 
 
 		 540 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  29.89 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  23.84 
 
 		 548 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  30.77 
 
 		 532 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.11 
 
 		 506 aa  55.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  27.89 
 
 		 601 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.71 
 
 		 485 aa  52.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  21.86 
 
 		 555 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.68 
 
 		 504 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 		 548 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 		 511 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  22.96 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.39 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  30.48 
 
 		 505 aa  45.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  24.34 
 
 		 518 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 580 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  32.63 
 
 		 261 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>