54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3889 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  100 
 
 		 560 aa  1151    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  57.47 
 
 		 526 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  55.13 
 
 		 539 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  55.33 
 
 		 550 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  55.19 
 
 		 541 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  53.45 
 
 		 540 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  34.96 
 
 		 622 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  30.16 
 
 		 585 aa  183  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  31.63 
 
 		 590 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  32.04 
 
 		 644 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  35.01 
 
 		 565 aa  173  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  28.03 
 
 		 544 aa  170  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  30.63 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  31.4 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  30.4 
 
 		 589 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  27.43 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  27.43 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  32.34 
 
 		 563 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  27.99 
 
 		 571 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  27.32 
 
 		 525 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  27.91 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  26.91 
 
 		 601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  25.54 
 
 		 532 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  29.72 
 
 		 503 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  25.35 
 
 		 681 aa  100  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  27.36 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  26.06 
 
 		 548 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  28.26 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.92 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.84 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  21.56 
 
 		 565 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  22.71 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  22.92 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.68 
 
 		 509 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  22.43 
 
 		 501 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.94 
 
 		 458 aa  51.6  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  22.72 
 
 		 522 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  20.69 
 
 		 494 aa  51.2  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  20.68 
 
 		 522 aa  50.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  21 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  22.1 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  23.13 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.9 
 
 		 510 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  23.75 
 
 		 525 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.08 
 
 		 498 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.52 
 
 		 613 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  21 
 
 		 590 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.74 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.75 
 
 		 554 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.24 
 
 		 542 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  22.42 
 
 		 447 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  24.25 
 
 		 467 aa  44.3  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  23.65 
 
 		 532 aa  43.9  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>