171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2774 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1335    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  46.67 
 
 		 590 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  41.47 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  43.54 
 
 		 544 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  34.58 
 
 		 622 aa  287  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  38.44 
 
 		 509 aa  281  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  40.48 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  42.24 
 
 		 545 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  35.83 
 
 		 589 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  33.48 
 
 		 563 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  33.91 
 
 		 681 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  32.59 
 
 		 508 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  32.59 
 
 		 508 aa  193  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  30.78 
 
 		 550 aa  189  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  34.32 
 
 		 526 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  32.04 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  28.47 
 
 		 571 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  28.6 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  29.8 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 		 503 aa  157  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  31.81 
 
 		 541 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  27.84 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  31.71 
 
 		 534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  31.74 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  29.59 
 
 		 532 aa  126  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 548 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  28.7 
 
 		 601 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 		 415 aa  89.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.47 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  24.76 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.49 
 
 		 537 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.46 
 
 		 462 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  25.23 
 
 		 550 aa  82  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.62 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  26.2 
 
 		 576 aa  79.7  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.29 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.07 
 
 		 569 aa  76.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.28 
 
 		 523 aa  76.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.28 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.89 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  27.51 
 
 		 540 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  25.28 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.24 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  28.98 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.56 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  26.55 
 
 		 516 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.15 
 
 		 506 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  23.89 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.41 
 
 		 496 aa  72  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.32 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  24.46 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  26.55 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.93 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 584 aa  70.5  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  26.3 
 
 		 542 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  25 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 		 542 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 		 542 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  24.34 
 
 		 532 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  32 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.07 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  25.32 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.51 
 
 		 517 aa  66.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.34 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  24.5 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.65 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  25.1 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  26.74 
 
 		 546 aa  63.9  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  25.49 
 
 		 549 aa  63.9  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.86 
 
 		 515 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  24.88 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  29.96 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.88 
 
 		 578 aa  62.4  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  26.87 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.15 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.35 
 
 		 494 aa  62  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.96 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.6 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.16 
 
 		 562 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  24.4 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3757  Resolvase domain protein  24.55 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.2 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  25.1 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.28 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  22.24 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  31.37 
 
 		 606 aa  58.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  31.37 
 
 		 606 aa  58.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  28.14 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  25 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  26.19 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.09 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.21 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.12 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  25 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  23.21 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  24.48 
 
 		 505 aa  57  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>