224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0143 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0143  recombinase  100 
 
 		 565 aa  1161    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  40.52 
 
 		 585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  41.47 
 
 		 644 aa  316  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  39.09 
 
 		 590 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  35.96 
 
 		 563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  34.58 
 
 		 544 aa  260  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  31.8 
 
 		 622 aa  256  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  34.74 
 
 		 589 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  33.86 
 
 		 509 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  30.66 
 
 		 571 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  36.75 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  39 
 
 		 526 aa  208  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  33.84 
 
 		 681 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  30.47 
 
 		 508 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  30.47 
 
 		 508 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  32.89 
 
 		 540 aa  187  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  32.54 
 
 		 539 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  37.28 
 
 		 560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  36.07 
 
 		 550 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  35.07 
 
 		 541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  31.08 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  32.49 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  25.37 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  26.63 
 
 		 532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  29.85 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  29.66 
 
 		 601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  27.95 
 
 		 548 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  21.64 
 
 		 506 aa  97.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.65 
 
 		 496 aa  92.8  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.57 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  23.65 
 
 		 578 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.41 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  23.43 
 
 		 540 aa  80.5  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.41 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.41 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.78 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.51 
 
 		 462 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.06 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.62 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  24.63 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  24.48 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.06 
 
 		 484 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.46 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  26.37 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.21 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  22.67 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.29 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.62 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  24.45 
 
 		 576 aa  75.1  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  27.03 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.18 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  23.11 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  26.76 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  24.19 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.81 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.79 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.4 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  23.71 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  23.14 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.62 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  24.46 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.6 
 
 		 528 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.01 
 
 		 528 aa  70.5  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  23.6 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.09 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.07 
 
 		 546 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.67 
 
 		 522 aa  70.1  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  22.99 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  24.2 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  24.74 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.47 
 
 		 539 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.63 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.4 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  26.02 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  23.9 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.56 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  22.77 
 
 		 500 aa  66.6  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.24 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  23.26 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.69 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.83 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  24.79 
 
 		 612 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.5 
 
 		 662 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.28 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.2 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  21.51 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 		 504 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  21.81 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.05 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  24.39 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.57 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  24.16 
 
 		 527 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23.56 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  22.97 
 
 		 555 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  24.03 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.17 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  29.94 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  26.12 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>