41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1644 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  60.75 
 
 		 540 aa  647    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  100 
 
 		 550 aa  1113    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  55.02 
 
 		 539 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  55.33 
 
 		 560 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  55.89 
 
 		 541 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  53.33 
 
 		 526 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  30.87 
 
 		 644 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  35.48 
 
 		 565 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  30.89 
 
 		 585 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  29.64 
 
 		 622 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  28.7 
 
 		 590 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  27.8 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  27.98 
 
 		 509 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  31.82 
 
 		 563 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  31.16 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  31.74 
 
 		 589 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  26.49 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  26.49 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 503 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  27.86 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  26.67 
 
 		 571 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  31.64 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  24.5 
 
 		 601 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  27.57 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  27.47 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  25.41 
 
 		 681 aa  88.6  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  26.15 
 
 		 552 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  25.27 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  22.77 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  20.92 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  24.72 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  24.72 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.42 
 
 		 465 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  21.28 
 
 		 586 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  21.74 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3757  Resolvase domain protein  26.89 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.39 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.35 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.35 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  23.18 
 
 		 460 aa  44.3  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  18.84 
 
 		 421 aa  44.3  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>