92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3468 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3468  recombinase  100 
 
 		 571 aa  1172    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  30.41 
 
 		 565 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  31.01 
 
 		 585 aa  203  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  29.62 
 
 		 590 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  30.65 
 
 		 509 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  30.19 
 
 		 622 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  28.47 
 
 		 644 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  32.35 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  34.53 
 
 		 544 aa  169  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  32.55 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  32.55 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  32.2 
 
 		 545 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  32.85 
 
 		 589 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  27.99 
 
 		 560 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  30.36 
 
 		 503 aa  130  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  26.29 
 
 		 681 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  27.54 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  25.9 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  27.27 
 
 		 541 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  26.67 
 
 		 550 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  26.55 
 
 		 540 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  25.91 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  27.38 
 
 		 525 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  25.33 
 
 		 534 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  27.22 
 
 		 506 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  24.09 
 
 		 601 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.3 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.59 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.49 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  23.98 
 
 		 548 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.76 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  21.55 
 
 		 479 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  23.25 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  20.08 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.01 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.87 
 
 		 515 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  22.57 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  23.17 
 
 		 504 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.27 
 
 		 540 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  28.93 
 
 		 414 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  21.66 
 
 		 562 aa  54.7  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.49 
 
 		 462 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  22.16 
 
 		 552 aa  53.9  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  23.11 
 
 		 578 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.18 
 
 		 494 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  23.84 
 
 		 526 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.92 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  21.24 
 
 		 429 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  23.24 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.11 
 
 		 542 aa  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  21.84 
 
 		 511 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3757  Resolvase domain protein  23.36 
 
 		 341 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  21.15 
 
 		 517 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  23.26 
 
 		 547 aa  50.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  25.83 
 
 		 534 aa  50.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 542 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  25.25 
 
 		 590 aa  50.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 		 542 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.89 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  25.3 
 
 		 460 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.71 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.7 
 
 		 510 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.14 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  31.21 
 
 		 526 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  25.38 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.51 
 
 		 515 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1368  recombinase  28.37 
 
 		 453 aa  48.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118986  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  22.55 
 
 		 563 aa  47.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  20.72 
 
 		 421 aa  47.8  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 546 aa  47.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  23.46 
 
 		 505 aa  47.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  24.33 
 
 		 555 aa  47  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  22.38 
 
 		 601 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  25 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.17 
 
 		 543 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  22.24 
 
 		 578 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 551 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  22.26 
 
 		 539 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  22.1 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  21.12 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  21.2 
 
 		 553 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  23.47 
 
 		 549 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  21.21 
 
 		 444 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  21.68 
 
 		 521 aa  44.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  22.74 
 
 		 597 aa  44.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  22.65 
 
 		 565 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  31.03 
 
 		 584 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  21.51 
 
 		 561 aa  44.3  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  21.12 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.53 
 
 		 517 aa  43.9  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>