177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1402 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  100 
 
 		 534 aa  1106    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  90.45 
 
 		 534 aa  1016    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  45.9 
 
 		 521 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  45.9 
 
 		 521 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  45.53 
 
 		 523 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  45.73 
 
 		 523 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  45.8 
 
 		 537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  45.77 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  45.58 
 
 		 521 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  43.79 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  43.79 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  45.18 
 
 		 521 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  44.62 
 
 		 519 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  43.59 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  44.58 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  43.91 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  40.68 
 
 		 518 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  40.48 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  40.48 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  40.59 
 
 		 518 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  40.64 
 
 		 519 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  36.77 
 
 		 568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  50 
 
 		 328 aa  290  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  45.14 
 
 		 339 aa  213  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  32.88 
 
 		 559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 537 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  24.85 
 
 		 547 aa  90.5  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  30.03 
 
 		 548 aa  83.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.7 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.15 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  49.43 
 
 		 157 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  29.39 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  27.12 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.16 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.08 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  27.69 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  28.62 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.06 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.33 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  26.14 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  27.69 
 
 		 549 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.76 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.63 
 
 		 590 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  28.17 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  27.27 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.84 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.38 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.76 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.73 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  26.77 
 
 		 535 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  27.53 
 
 		 558 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  24.48 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.3 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  25.87 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.06 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.94 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.47 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  23.28 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  26.28 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  25.42 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.78 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  27.63 
 
 		 522 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.03 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  26.95 
 
 		 576 aa  69.7  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  29.43 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.23 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  26.62 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  26.62 
 
 		 601 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  23.1 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  26.64 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 542 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 542 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.1 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  27.02 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.4 
 
 		 551 aa  67.4  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  26.97 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.72 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  27.09 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.21 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.72 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.58 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  24.5 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  28.44 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  28.67 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.28 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.48 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.64 
 
 		 562 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.67 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  25.74 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.05 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.44 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.94 
 
 		 586 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  23.29 
 
 		 565 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.39 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.69 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>