193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2888 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02510  Recombinase  86.29 
 
 		 518 aa  937    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  86.29 
 
 		 518 aa  937    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  86.29 
 
 		 518 aa  936    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  100 
 
 		 518 aa  1063    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  56.43 
 
 		 519 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  47.66 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  47.66 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  44.88 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  41.63 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  41.83 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  43.7 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  43.7 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  44.74 
 
 		 497 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  41.85 
 
 		 537 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  42.23 
 
 		 521 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  43.06 
 
 		 521 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  42.49 
 
 		 519 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  41.49 
 
 		 521 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  42.03 
 
 		 528 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  41.13 
 
 		 534 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  40.59 
 
 		 534 aa  392  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  37.02 
 
 		 568 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  42.9 
 
 		 328 aa  266  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  47.41 
 
 		 339 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  36.22 
 
 		 559 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  29.22 
 
 		 506 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  52.33 
 
 		 157 aa  91.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.88 
 
 		 541 aa  91.3  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.48 
 
 		 524 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  28.93 
 
 		 547 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.38 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.21 
 
 		 548 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 		 542 aa  86.7  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.11 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.92 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  29.83 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 		 517 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  27.57 
 
 		 563 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  25.63 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  23.39 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.89 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.51 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.38 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  30.08 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  28.94 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.24 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.73 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.8 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.65 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  27.54 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.29 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.36 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  26.95 
 
 		 606 aa  70.9  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  26.95 
 
 		 606 aa  70.9  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  28.24 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.6 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  25.61 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  26.38 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  27.86 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  23.17 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.29 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  26.17 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  27.82 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.96 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.57 
 
 		 498 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  27.59 
 
 		 523 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.34 
 
 		 521 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.54 
 
 		 613 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.67 
 
 		 496 aa  66.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  23.81 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.6 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  26.62 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.72 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.57 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  26.89 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.33 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  28.32 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.5 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  26.96 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2538  recombinase  23.64 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.28 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.93 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  26.36 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.85 
 
 		 662 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  24.5 
 
 		 336 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  25.94 
 
 		 564 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  26.1 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.99 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.84 
 
 		 584 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  25.6 
 
 		 578 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  25.6 
 
 		 601 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  23 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.82 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.75 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>