165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2982 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  74.8 
 
 		 521 aa  788    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  72.39 
 
 		 537 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  84.57 
 
 		 521 aa  882    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  100 
 
 		 521 aa  1063    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  84.57 
 
 		 521 aa  882    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  75.35 
 
 		 521 aa  791    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  61.76 
 
 		 497 aa  624  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  58.65 
 
 		 518 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  58.65 
 
 		 518 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  57.76 
 
 		 523 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  58.88 
 
 		 524 aa  621  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  57.56 
 
 		 523 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  55.95 
 
 		 519 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  56.29 
 
 		 528 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  45.6 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  43.06 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  42.86 
 
 		 518 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  42.86 
 
 		 518 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  82 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  45.18 
 
 		 534 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  41.49 
 
 		 518 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  44.58 
 
 		 534 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  44.89 
 
 		 568 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  57.43 
 
 		 328 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  41.67 
 
 		 559 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  58.62 
 
 		 157 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  28.36 
 
 		 563 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  29.17 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.13 
 
 		 517 aa  93.6  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.62 
 
 		 494 aa  91.3  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.2 
 
 		 562 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  29.35 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.18 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  30.19 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 		 548 aa  84.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.07 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  27.35 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  27.85 
 
 		 542 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27.85 
 
 		 554 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.3 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.4 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.31 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.73 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  27.35 
 
 		 549 aa  77  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  28.43 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.08 
 
 		 541 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  28.66 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  29.31 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.51 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  27.1 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.44 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.89 
 
 		 597 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.59 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.21 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.07 
 
 		 578 aa  67.4  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.19 
 
 		 540 aa  67.4  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.56 
 
 		 547 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 		 584 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.53 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  27.12 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  27.12 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  29.92 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.23 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  24.71 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  28.71 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.77 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.48 
 
 		 546 aa  63.9  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.24 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.69 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  24.77 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  25.64 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.68 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  28.52 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  23.17 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  23.49 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.52 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.52 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  29.1 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  26.64 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.52 
 
 		 542 aa  60.1  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.47 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.46 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.19 
 
 		 662 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.62 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.17 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  26.06 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  27.88 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  24 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  24 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  23.44 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  27.15 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  26.22 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.15 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  27.21 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>