93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0347 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  695    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  82.4 
 
 		 521 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  82 
 
 		 521 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  82.4 
 
 		 521 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  81.03 
 
 		 521 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  81.03 
 
 		 521 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  79.05 
 
 		 537 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  69.53 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  67.2 
 
 		 523 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  67.2 
 
 		 523 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  67.32 
 
 		 524 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  67.07 
 
 		 519 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  63.67 
 
 		 518 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  63.67 
 
 		 518 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  61.54 
 
 		 528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  53.94 
 
 		 568 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  49.4 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  49.4 
 
 		 518 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  49.4 
 
 		 518 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  48.4 
 
 		 519 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  48.5 
 
 		 518 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  45.14 
 
 		 534 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  45.45 
 
 		 534 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  41.67 
 
 		 559 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  68.06 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.2 
 
 		 506 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 548 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  27.66 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  53.23 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.47 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.78 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  27.87 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.09 
 
 		 511 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  23.26 
 
 		 537 aa  66.2  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.61 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.45 
 
 		 496 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.76 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.02 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  24.24 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.58 
 
 		 555 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  27.17 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.27 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  26.36 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.56 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  25.31 
 
 		 590 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  27.5 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.27 
 
 		 562 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.95 
 
 		 576 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.24 
 
 		 547 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.9 
 
 		 462 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.83 
 
 		 485 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  25 
 
 		 504 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  25.97 
 
 		 656 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.65 
 
 		 549 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.76 
 
 		 597 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.26 
 
 		 539 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  28.14 
 
 		 578 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  28.14 
 
 		 601 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  26.61 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.65 
 
 		 578 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.81 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.59 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  21.72 
 
 		 487 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 		 564 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  27.95 
 
 		 598 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  23.24 
 
 		 515 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  28.35 
 
 		 558 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  29.69 
 
 		 626 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.05 
 
 		 523 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  38.89 
 
 		 612 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.31 
 
 		 537 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  24.58 
 
 		 431 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  23.65 
 
 		 526 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.9 
 
 		 540 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  26.34 
 
 		 549 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  34.52 
 
 		 521 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  29.37 
 
 		 743 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.05 
 
 		 522 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  29.01 
 
 		 490 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.56 
 
 		 541 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  24.59 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.21 
 
 		 523 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  26.79 
 
 		 526 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  29.69 
 
 		 501 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2733  recombinase  29.92 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 584 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  21.83 
 
 		 517 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2538  recombinase  31.5 
 
 		 241 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>