178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3109 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0526  recombinase  74.25 
 
 		 524 aa  790    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  100 
 
 		 497 aa  1011    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  60.56 
 
 		 523 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  61.86 
 
 		 521 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  61.76 
 
 		 521 aa  624  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  60.76 
 
 		 523 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  61.48 
 
 		 521 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  61.6 
 
 		 521 aa  621  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  61.6 
 
 		 521 aa  621  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  61.07 
 
 		 537 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  60.76 
 
 		 519 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  58.35 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  58.35 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  61.26 
 
 		 528 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  45.92 
 
 		 519 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  45.56 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  45.16 
 
 		 518 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  45.16 
 
 		 518 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  44.74 
 
 		 518 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  44.58 
 
 		 534 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  45.24 
 
 		 568 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  43.78 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  69.53 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  61.06 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  40.96 
 
 		 559 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  29.94 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  30.03 
 
 		 549 aa  94.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.69 
 
 		 494 aa  94.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 510 aa  94  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 		 517 aa  94  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  53.09 
 
 		 157 aa  90.9  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  30.27 
 
 		 541 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  29.51 
 
 		 336 aa  87  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  29.51 
 
 		 569 aa  86.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.09 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.23 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.18 
 
 		 542 aa  84.3  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.18 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.4 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  29.61 
 
 		 562 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  28.32 
 
 		 578 aa  82.4  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.92 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  29.47 
 
 		 576 aa  81.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.06 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.6 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  30.08 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.71 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  27.62 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  27.62 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  28.7 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.24 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.24 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.75 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.3 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.65 
 
 		 597 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.38 
 
 		 521 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.21 
 
 		 662 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  25.49 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.28 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.15 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.56 
 
 		 551 aa  71.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  24.36 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.65 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.97 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.2 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  28.83 
 
 		 552 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  25.66 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.05 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.18 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.62 
 
 		 564 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  29.17 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  24.76 
 
 		 547 aa  66.6  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  26.22 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  28.32 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.57 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.62 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  23.61 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.07 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.56 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  28.25 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  26.64 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.42 
 
 		 613 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24.24 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.17 
 
 		 521 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  29.88 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.58 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  27.24 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  27.5 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  26.64 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  35.96 
 
 		 485 aa  62  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  26.89 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>