55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2538 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2538  recombinase  100 
 
 		 241 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2733  recombinase  62.38 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1686  recombinase  61.28 
 
 		 231 aa  225  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0526693  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1341  recombinase  44.2 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  35.95 
 
 		 656 aa  72  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  27.54 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  27.54 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  24.89 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  24.89 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  24.89 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  22.66 
 
 		 518 aa  58.9  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  30.25 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  30.67 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  32.73 
 
 		 521 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  23.7 
 
 		 504 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  26.38 
 
 		 515 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  25.56 
 
 		 519 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  27.34 
 
 		 535 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  25.9 
 
 		 515 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.09 
 
 		 475 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  30.67 
 
 		 521 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  30.67 
 
 		 521 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  28.42 
 
 		 568 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  28.43 
 
 		 534 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.67 
 
 		 487 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  27.41 
 
 		 534 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  30.56 
 
 		 521 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  31.29 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  26.22 
 
 		 518 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  26.22 
 
 		 518 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  22.02 
 
 		 517 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.14 
 
 		 484 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  30.59 
 
 		 409 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.14 
 
 		 484 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25 
 
 		 498 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.15 
 
 		 539 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  28.19 
 
 		 598 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 524 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  36.51 
 
 		 504 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  32.61 
 
 		 563 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  25.62 
 
 		 552 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  35.45 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25 
 
 		 479 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  31.5 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.99 
 
 		 613 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2039  Recombinase  27.5 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  29.81 
 
 		 738 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.32 
 
 		 510 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  29.07 
 
 		 519 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4855  resolvase domain-containing protein  29.66 
 
 		 694 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0344697  normal  0.666269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4901  resolvase domain-containing protein  29.66 
 
 		 694 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6949  resolvase domain-containing protein  29.66 
 
 		 694 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7439  resolvase domain-containing protein  29.66 
 
 		 694 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7628  resolvase domain-containing protein  29.66 
 
 		 694 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  30.67 
 
 		 485 aa  41.6  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>