164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0612 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0612  recombinase  100 
 
 		 656 aa  1349    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  39.58 
 
 		 598 aa  346  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3586  Resolvase domain-containing protein  36.04 
 
 		 401 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  30.8 
 
 		 556 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  29.38 
 
 		 575 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  28.92 
 
 		 583 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  29.25 
 
 		 465 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  27.55 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  27.55 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  27.55 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  26.16 
 
 		 548 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  27.79 
 
 		 488 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  28.92 
 
 		 409 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  33.8 
 
 		 386 aa  92  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.62 
 
 		 554 aa  88.6  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.32 
 
 		 506 aa  88.6  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.3 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  30.15 
 
 		 521 aa  85.1  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2733  recombinase  37.16 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.01 
 
 		 542 aa  84.3  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.69 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.4 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  22.43 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  28.2 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  24.59 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1686  recombinase  38.41 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0526693  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  29.3 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.46 
 
 		 510 aa  77  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.37 
 
 		 613 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.15 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.99 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.06 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2538  recombinase  35.95 
 
 		 241 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.68 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  26.7 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  26.7 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.91 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.48 
 
 		 509 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  24.71 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  24.71 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.37 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 540 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  27.21 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  27.21 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  24.06 
 
 		 743 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.55 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.91 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  24.1 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  28.57 
 
 		 331 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.19 
 
 		 506 aa  67  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.33 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  23.57 
 
 		 579 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  24.17 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.46 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.39 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  23.91 
 
 		 548 aa  64.3  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  20.48 
 
 		 504 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  20.47 
 
 		 496 aa  63.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  22.5 
 
 		 555 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  22.5 
 
 		 550 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  26.25 
 
 		 559 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  23.89 
 
 		 519 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  26.27 
 
 		 542 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  31.33 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.5 
 
 		 558 aa  62  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  22.59 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  27.03 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  29.24 
 
 		 516 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  24.11 
 
 		 543 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  24.11 
 
 		 543 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  26.69 
 
 		 539 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  26.72 
 
 		 542 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  29.24 
 
 		 516 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.01 
 
 		 498 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  22.38 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  21.03 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1341  recombinase  36.54 
 
 		 225 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  24.28 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  22.7 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  26.69 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  23.96 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.92 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  21.07 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  24.92 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.89 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  25.46 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  24.82 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  23.54 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0611  hypothetical protein  32.84 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.54 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  22.93 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  23.99 
 
 		 569 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  26.42 
 
 		 597 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  28.79 
 
 		 513 aa  57  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2325  recombinase  22.85 
 
 		 697 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.25 
 
 		 564 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  22.91 
 
 		 563 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>