204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2909 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2909  recombinase  100 
 
 		 465 aa  964    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  59.87 
 
 		 575 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  54.41 
 
 		 556 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  55.82 
 
 		 583 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  41.51 
 
 		 548 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  41.51 
 
 		 548 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  41.51 
 
 		 548 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  39.96 
 
 		 548 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  40.95 
 
 		 488 aa  239  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  42.67 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  38.34 
 
 		 409 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  25.62 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1959  hypothetical protein  73.56 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.403794  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  34.11 
 
 		 331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  29.25 
 
 		 656 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.4 
 
 		 498 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2661  hypothetical protein  35.42 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0202232  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.54 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.97 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  27.08 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  26.71 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.42 
 
 		 519 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.26 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.27 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.82 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  29.63 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23.69 
 
 		 535 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.4 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  30.35 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.72 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  28.74 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  24.03 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.96 
 
 		 539 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  28.74 
 
 		 484 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 		 548 aa  67  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.19 
 
 		 526 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  27.31 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  23.48 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  26.94 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.1 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  27.22 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  25.29 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.99 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  23.81 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.19 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.16 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  23.97 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  23.71 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 		 554 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  34.56 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.75 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.27 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.99 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.26 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  21.85 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  24.3 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.1 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  20.95 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.94 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  30.99 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  24.19 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  23.53 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  29.63 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  22.01 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.48 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  21.7 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  30.43 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  29.27 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.76 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  25.56 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  31.43 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  27 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  25.74 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  30.41 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.81 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.76 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  25.69 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.8 
 
 		 540 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.01 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  26.07 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.04 
 
 		 665 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.63 
 
 		 553 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23.41 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.5 
 
 		 272 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  28.05 
 
 		 551 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.48 
 
 		 546 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 540 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  23.53 
 
 		 523 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  25.11 
 
 		 689 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  25.11 
 
 		 689 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  21.61 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  28.9 
 
 		 578 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>