278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3285 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  100 
 
 		 554 aa  1150    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  44.74 
 
 		 550 aa  457  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  43.18 
 
 		 551 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  37.15 
 
 		 539 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  34.01 
 
 		 612 aa  273  7e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  46.06 
 
 		 274 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  28.33 
 
 		 541 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  29.85 
 
 		 475 aa  177  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  26.91 
 
 		 537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  28.1 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  28.22 
 
 		 479 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.91 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.76 
 
 		 517 aa  127  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.22 
 
 		 522 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.27 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.77 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  26.05 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  25.45 
 
 		 516 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.3 
 
 		 515 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.19 
 
 		 563 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  23.69 
 
 		 534 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.7 
 
 		 524 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.12 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.81 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.55 
 
 		 606 aa  97.1  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.55 
 
 		 606 aa  97.1  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  22.84 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  26 
 
 		 578 aa  96.3  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.44 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.13 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.77 
 
 		 586 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  26.63 
 
 		 535 aa  94.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 		 542 aa  94  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 		 554 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.11 
 
 		 534 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.17 
 
 		 445 aa  93.2  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25 
 
 		 527 aa  92  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.91 
 
 		 548 aa  92  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.69 
 
 		 528 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.69 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.75 
 
 		 489 aa  90.1  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.19 
 
 		 540 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.22 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.16 
 
 		 510 aa  89  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  26.44 
 
 		 500 aa  88.2  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.26 
 
 		 475 aa  88.2  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  24.23 
 
 		 564 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.06 
 
 		 445 aa  88.2  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  24.04 
 
 		 412 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  23.81 
 
 		 547 aa  87  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  24.63 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.03 
 
 		 521 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.16 
 
 		 542 aa  85.5  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  22.05 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.16 
 
 		 542 aa  84  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.16 
 
 		 542 aa  84  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.15 
 
 		 546 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  23.14 
 
 		 515 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.74 
 
 		 522 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  27.47 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  25.25 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.41 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  24.33 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  24.02 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  23.95 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  22.63 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  24.58 
 
 		 343 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  24.78 
 
 		 542 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.24 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  22.42 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  24.02 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  24.79 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  24.83 
 
 		 526 aa  77  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.06 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  24.62 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  23.82 
 
 		 579 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  19.44 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  22.55 
 
 		 558 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  22.68 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.4 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  26.69 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.44 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  22.82 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  21.91 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  23.42 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  20.58 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  23.59 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.74 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.34 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  22.48 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  22.01 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  23 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.66 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.38 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  23.11 
 
 		 576 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>