36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2656 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  673    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2661  hypothetical protein  76.33 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0202232  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  30.72 
 
 		 575 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  34.11 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  31.49 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  31.78 
 
 		 583 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  32.32 
 
 		 548 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  32.32 
 
 		 548 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  32.32 
 
 		 548 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  31.56 
 
 		 548 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  29.8 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  28.52 
 
 		 556 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  29.12 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  27.55 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  28.57 
 
 		 656 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.38 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  27.88 
 
 		 532 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.88 
 
 		 541 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  24.57 
 
 		 516 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  24.57 
 
 		 516 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  25.11 
 
 		 520 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  27.32 
 
 		 452 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  31.73 
 
 		 498 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.62 
 
 		 510 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  23.76 
 
 		 554 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  25.67 
 
 		 550 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  24.05 
 
 		 562 aa  46.2  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.96 
 
 		 537 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 519 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25 
 
 		 537 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.56 
 
 		 561 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  25.23 
 
 		 552 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  24.62 
 
 		 551 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  25 
 
 		 568 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.74 
 
 		 426 aa  43.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  21.61 
 
 		 526 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>