170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3227 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  100 
 
 		 548 aa  1101    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  100 
 
 		 548 aa  1101    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  100 
 
 		 548 aa  1101    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  89.05 
 
 		 548 aa  991    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  47.97 
 
 		 575 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  48.53 
 
 		 583 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  45.73 
 
 		 556 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  41.51 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  40.4 
 
 		 488 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  41.8 
 
 		 386 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  39.7 
 
 		 409 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  31.28 
 
 		 598 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  28.41 
 
 		 656 aa  106  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  32.32 
 
 		 331 aa  93.2  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.51 
 
 		 561 aa  92  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.88 
 
 		 516 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.84 
 
 		 485 aa  90.9  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.15 
 
 		 548 aa  90.1  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.67 
 
 		 516 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.29 
 
 		 547 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  21.88 
 
 		 541 aa  87.8  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.75 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.75 
 
 		 542 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  22.55 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.72 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  22.55 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.2 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  26.91 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2661  hypothetical protein  38.33 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0202232  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.36 
 
 		 590 aa  80.1  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.36 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.51 
 
 		 565 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.09 
 
 		 551 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  22.03 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  20.98 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.58 
 
 		 579 aa  74.7  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  27.07 
 
 		 707 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.54 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  23.38 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.31 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.95 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.86 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  21.5 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  23.56 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  25.95 
 
 		 561 aa  70.5  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23.44 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.55 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  29.3 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.39 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  24.1 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.65 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  21.81 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  25.17 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.44 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  27.73 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.11 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.56 
 
 		 526 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  21.66 
 
 		 586 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.44 
 
 		 524 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.74 
 
 		 475 aa  67  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  22.34 
 
 		 500 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  23.53 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.31 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  27.43 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.93 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  26.45 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.35 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  21.03 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.38 
 
 		 555 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  33.55 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.54 
 
 		 525 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.97 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.97 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  22.86 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  21.9 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.27 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  21.5 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.9 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.16 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.06 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.16 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.29 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  21.87 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.31 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.52 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  26.82 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.4 
 
 		 539 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  25.75 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  22.51 
 
 		 552 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  26.04 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 546 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  22.11 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  23.7 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  21.07 
 
 		 522 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.11 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.88 
 
 		 552 aa  55.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 522 aa  54.7  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  20.98 
 
 		 519 aa  54.7  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  21.39 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>