184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3036 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  89.05 
 
 		 548 aa  991    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  89.05 
 
 		 548 aa  991    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  89.05 
 
 		 548 aa  991    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  100 
 
 		 548 aa  1102    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  47.13 
 
 		 583 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  46.47 
 
 		 575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  44.84 
 
 		 556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  39.96 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  41.29 
 
 		 488 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  40.61 
 
 		 386 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  39.16 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  28.28 
 
 		 598 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  26.16 
 
 		 656 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  31.56 
 
 		 331 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.35 
 
 		 540 aa  90.9  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.04 
 
 		 590 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.08 
 
 		 561 aa  87.8  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  29.41 
 
 		 516 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.4 
 
 		 517 aa  87.4  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  20.65 
 
 		 532 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  20.65 
 
 		 526 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  28.99 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.93 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  21.86 
 
 		 580 aa  83.6  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  21.44 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  22.67 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.02 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  23.04 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.94 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  21.66 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  25.7 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2661  hypothetical protein  37.96 
 
 		 317 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0202232  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.4 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  21.88 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.7 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  26.68 
 
 		 707 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.73 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  21.81 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  23.37 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.11 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.54 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  27.47 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  34.19 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  27.22 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.86 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  24.58 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  22.12 
 
 		 517 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  21.89 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  22.29 
 
 		 554 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.92 
 
 		 562 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.13 
 
 		 552 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.38 
 
 		 586 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.49 
 
 		 555 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.46 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.63 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.65 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.03 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  27.4 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.56 
 
 		 662 aa  64.7  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.28 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  26.45 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.33 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.82 
 
 		 515 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  25.23 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  27.81 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.02 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.43 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.43 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.53 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.74 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.24 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  27 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.74 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.69 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  21.72 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  28.46 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  22.89 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.69 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  21.69 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.21 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.31 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  21.04 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.71 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  21.22 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  25.15 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.58 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.13 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  23.79 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  25.78 
 
 		 550 aa  57  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  19.81 
 
 		 500 aa  57  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.16 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.57 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  22.99 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.1 
 
 		 539 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  21.28 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>