167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3094 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3094  recombinase  100 
 
 		 386 aa  793    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  47.45 
 
 		 488 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  50.16 
 
 		 409 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  42.67 
 
 		 465 aa  238  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  41.69 
 
 		 575 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  41.4 
 
 		 583 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  39.12 
 
 		 556 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  40.61 
 
 		 548 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  41.8 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  41.8 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  41.8 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  33.8 
 
 		 656 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  29.8 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  27.34 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  28.3 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  29.86 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  30.33 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  32.67 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  24.2 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  24.2 
 
 		 516 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  32.99 
 
 		 562 aa  72.8  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  28.34 
 
 		 526 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.13 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.13 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  30.43 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  33.33 
 
 		 537 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  30.54 
 
 		 552 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.79 
 
 		 485 aa  67  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  29.19 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  32.92 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  30.65 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  29.57 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  25.62 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  27.69 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  25.81 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  30.65 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  28.93 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.52 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  27.17 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.38 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  31.66 
 
 		 569 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.78 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  27.27 
 
 		 563 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  24.62 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  31.5 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  31.5 
 
 		 601 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  24.76 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2661  hypothetical protein  34.19 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0202232  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.19 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  24.7 
 
 		 689 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.7 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  26.84 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  25.96 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  29.27 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  37.14 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  33.94 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  23.87 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  30.66 
 
 		 576 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.62 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  28.07 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  23.59 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  31 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  29.47 
 
 		 531 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  23.79 
 
 		 532 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.83 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  21.18 
 
 		 606 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  21.18 
 
 		 606 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  23.59 
 
 		 519 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  27.34 
 
 		 626 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.78 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  27.14 
 
 		 564 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  22.29 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  27.92 
 
 		 532 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  29.95 
 
 		 578 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  29.58 
 
 		 707 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  29.33 
 
 		 549 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  29.44 
 
 		 277 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  25.17 
 
 		 689 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  25.17 
 
 		 689 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  25.17 
 
 		 689 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.34 
 
 		 509 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  22.18 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  22.03 
 
 		 541 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  22.09 
 
 		 272 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.25 
 
 		 539 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.69 
 
 		 415 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.99 
 
 		 525 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.74 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  28.11 
 
 		 579 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  30.95 
 
 		 563 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25 
 
 		 544 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  22.06 
 
 		 552 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  28.31 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  27.09 
 
 		 501 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  25 
 
 		 550 aa  50.8  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.23 
 
 		 525 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>