More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0693 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  100 
 
 
606 aa  1238    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  100 
 
 
606 aa  1238    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  53.87 
 
 
342 aa  342  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  38.31 
 
 
523 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  38.48 
 
 
523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  45.27 
 
 
523 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  38.07 
 
 
523 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  37.69 
 
 
522 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  37.73 
 
 
535 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  45.22 
 
 
522 aa  318  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  36.18 
 
 
539 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  36.73 
 
 
526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  46.11 
 
 
442 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  38.66 
 
 
552 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  35.52 
 
 
518 aa  300  7e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  36.11 
 
 
543 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 
519 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  34.76 
 
 
519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  40.94 
 
 
431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  35.5 
 
 
522 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  34.48 
 
 
521 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  34.28 
 
 
520 aa  276  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  35.5 
 
 
522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  45.24 
 
 
429 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  41.69 
 
 
506 aa  267  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.47 
 
 
553 aa  259  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  41.26 
 
 
430 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  41.74 
 
 
534 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  32.93 
 
 
526 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  32.28 
 
 
547 aa  223  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  31.3 
 
 
511 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  32.89 
 
 
321 aa  155  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 
521 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  27.46 
 
 
479 aa  143  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  30 
 
 
535 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.76 
 
 
496 aa  137  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.41 
 
 
475 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.26 
 
 
488 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.4 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.1 
 
 
487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.02 
 
 
498 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  26.04 
 
 
665 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.12 
 
 
537 aa  127  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.45 
 
 
542 aa  126  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  30.49 
 
 
613 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 
542 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 
542 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  33.23 
 
 
506 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 
517 aa  123  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.38 
 
 
539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.3 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  23.21 
 
 
612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.74 
 
 
494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.88 
 
 
528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.88 
 
 
528 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.28 
 
 
522 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.49 
 
 
546 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  22.92 
 
 
569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  27.82 
 
 
548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  27 
 
 
542 aa  115  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.93 
 
 
537 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.86 
 
 
534 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.63 
 
 
534 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.53 
 
 
527 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.86 
 
 
541 aa  114  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.61 
 
 
534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  29.54 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.61 
 
 
534 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  23.12 
 
 
551 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  27.61 
 
 
537 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.36 
 
 
534 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 
415 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.04 
 
 
447 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  25 
 
 
550 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  25.33 
 
 
551 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  23.4 
 
 
552 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.11 
 
 
534 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.21 
 
 
510 aa  107  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.3 
 
 
445 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  24.54 
 
 
541 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.39 
 
 
515 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 
549 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.76 
 
 
445 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  24.09 
 
 
555 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27.76 
 
 
445 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  24.09 
 
 
550 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.41 
 
 
421 aa  104  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.9 
 
 
489 aa  103  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.26 
 
 
441 aa  103  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  21.4 
 
 
525 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.21 
 
 
500 aa  102  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  23.89 
 
 
500 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  23.51 
 
 
542 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24.02 
 
 
525 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.87 
 
 
465 aa  102  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  23.53 
 
 
525 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.86 
 
 
511 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 
441 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2698  hypothetical protein  34.3 
 
 
194 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>