215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2537 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  61.69 
 
 		 583 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  100 
 
 		 556 aa  1145    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  57.32 
 
 		 575 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  54.41 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  45.73 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  45.73 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  45.73 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  44.84 
 
 		 548 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  43.78 
 
 		 488 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  40.85 
 
 		 409 aa  240  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  39.12 
 
 		 386 aa  230  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  26.55 
 
 		 598 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  29.52 
 
 		 656 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  22.93 
 
 		 517 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.91 
 
 		 510 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.98 
 
 		 485 aa  92.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  23.15 
 
 		 541 aa  92  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.66 
 
 		 558 aa  91.3  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.35 
 
 		 506 aa  90.5  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  28.05 
 
 		 532 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.33 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  24.37 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  28.52 
 
 		 331 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  23.68 
 
 		 597 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  25.65 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  23.68 
 
 		 601 aa  81.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  23.68 
 
 		 578 aa  80.9  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25.65 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.14 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  22.7 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  27.52 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  23.22 
 
 		 578 aa  77.4  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.92 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  26.47 
 
 		 524 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.08 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  26.25 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.37 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  22.93 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.44 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.74 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.98 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.42 
 
 		 540 aa  73.6  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.97 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  32.26 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2661  hypothetical protein  32.64 
 
 		 317 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0202232  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.11 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.54 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  22.5 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.62 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.24 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.42 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.22 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  24.46 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.42 
 
 		 484 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  23.96 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  21.91 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.23 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.52 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.1 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.3 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  26.96 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.41 
 
 		 520 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  21.79 
 
 		 272 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  20.03 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.16 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  24.87 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  24.54 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  24.92 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  25.9 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  22.95 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 		 564 aa  64.3  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  25.48 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  21.2 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  21.99 
 
 		 584 aa  63.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  22.64 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  24.9 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  23.61 
 
 		 547 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  25.23 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.8 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  25.21 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.4 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  25.21 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.4 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.07 
 
 		 539 aa  60.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  25.22 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  24.89 
 
 		 539 aa  60.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  29.34 
 
 		 414 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  25 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.63 
 
 		 551 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.36 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  20.05 
 
 		 552 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  23.43 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  30.1 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  20.24 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>